Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIW5

Twnk, Twinkle protein, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwnkQ8CIW5 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TwnkQ8CIW5 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TwnkQ8CIW5 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TwnkQ8CIW5 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TwnkQ8CIW5 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TwnkQ8CIW5 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TwnkQ8CIW5 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TwnkQ8CIW5 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TwnkQ8CIW5 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TwnkQ8CIW5 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TwnkQ8CIW5 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TwnkQ8CIW5 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TwnkQ8CIW5 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TwnkQ8CIW5 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TwnkQ8CIW5 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TwnkQ8CIW5 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TwnkQ8CIW5 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TwnkQ8CIW5 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TwnkQ8CIW5 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TwnkQ8CIW5 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TwnkQ8CIW5 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TwnkQ8CIW5 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TwnkQ8CIW5 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TwnkQ8CIW5 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TwnkQ8CIW5 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TwnkQ8CIW5 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TwnkQ8CIW5 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TwnkQ8CIW5 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TwnkQ8CIW5 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TwnkQ8CIW5 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TwnkQ8CIW5 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TwnkQ8CIW5 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TwnkQ8CIW5 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TwnkQ8CIW5 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TwnkQ8CIW5 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TwnkQ8CIW5 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TwnkQ8CIW5 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TwnkQ8CIW5 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TwnkQ8CIW5 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TwnkQ8CIW5 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TwnkQ8CIW5 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TwnkQ8CIW5 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TwnkQ8CIW5 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TwnkQ8CIW5 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TwnkQ8CIW5 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TwnkQ8CIW5 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TwnkQ8CIW5 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TwnkQ8CIW5 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TwnkQ8CIW5 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TwnkQ8CIW5 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TwnkQ8CIW5 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TwnkQ8CIW5 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TwnkQ8CIW5 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TwnkQ8CIW5 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TwnkQ8CIW5 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TwnkQ8CIW5 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TwnkQ8CIW5 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TwnkQ8CIW5 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TwnkQ8CIW5 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TwnkQ8CIW5 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TwnkQ8CIW5 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TwnkQ8CIW5 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TwnkQ8CIW5 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TwnkQ8CIW5 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TwnkQ8CIW5 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TwnkQ8CIW5 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TwnkQ8CIW5 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TwnkQ8CIW5 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TwnkQ8CIW5 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TwnkQ8CIW5 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TwnkQ8CIW5 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TwnkQ8CIW5 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TwnkQ8CIW5 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TwnkQ8CIW5 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TwnkQ8CIW5 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TwnkQ8CIW5 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TwnkQ8CIW5 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TwnkQ8CIW5 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TwnkQ8CIW5 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TwnkQ8CIW5 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TwnkQ8CIW5 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TwnkQ8CIW5 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TwnkQ8CIW5 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TwnkQ8CIW5 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TwnkQ8CIW5 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TwnkQ8CIW5 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TwnkQ8CIW5 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TwnkQ8CIW5 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TwnkQ8CIW5 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TwnkQ8CIW5 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TwnkQ8CIW5 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TwnkQ8CIW5 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TwnkQ8CIW5 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TwnkQ8CIW5 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TwnkQ8CIW5 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TwnkQ8CIW5 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TwnkQ8CIW5 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TwnkQ8CIW5 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TwnkQ8CIW5 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TwnkQ8CIW5 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms