Protein–RNA interactions for Protein: Q8CI71

Vps50, Syndetin, mousemouse

Predictions only

Length 964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps50Q8CI71 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps50Q8CI71 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps50Q8CI71 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps50Q8CI71 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps50Q8CI71 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps50Q8CI71 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps50Q8CI71 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps50Q8CI71 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps50Q8CI71 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps50Q8CI71 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps50Q8CI71 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vps50Q8CI71 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vps50Q8CI71 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vps50Q8CI71 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vps50Q8CI71 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vps50Q8CI71 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vps50Q8CI71 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vps50Q8CI71 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vps50Q8CI71 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vps50Q8CI71 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vps50Q8CI71 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vps50Q8CI71 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Vps50Q8CI71 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vps50Q8CI71 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vps50Q8CI71 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vps50Q8CI71 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vps50Q8CI71 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vps50Q8CI71 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vps50Q8CI71 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vps50Q8CI71 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vps50Q8CI71 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vps50Q8CI71 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vps50Q8CI71 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vps50Q8CI71 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Vps50Q8CI71 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps50Q8CI71 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps50Q8CI71 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps50Q8CI71 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps50Q8CI71 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps50Q8CI71 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps50Q8CI71 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps50Q8CI71 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps50Q8CI71 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps50Q8CI71 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps50Q8CI71 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps50Q8CI71 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps50Q8CI71 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps50Q8CI71 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps50Q8CI71 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps50Q8CI71 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps50Q8CI71 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps50Q8CI71 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps50Q8CI71 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps50Q8CI71 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps50Q8CI71 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps50Q8CI71 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps50Q8CI71 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps50Q8CI71 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps50Q8CI71 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps50Q8CI71 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps50Q8CI71 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps50Q8CI71 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps50Q8CI71 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps50Q8CI71 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps50Q8CI71 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps50Q8CI71 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps50Q8CI71 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps50Q8CI71 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps50Q8CI71 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps50Q8CI71 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps50Q8CI71 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps50Q8CI71 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps50Q8CI71 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps50Q8CI71 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps50Q8CI71 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps50Q8CI71 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps50Q8CI71 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps50Q8CI71 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps50Q8CI71 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps50Q8CI71 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps50Q8CI71 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps50Q8CI71 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps50Q8CI71 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps50Q8CI71 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps50Q8CI71 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps50Q8CI71 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps50Q8CI71 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps50Q8CI71 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps50Q8CI71 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vps50Q8CI71 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vps50Q8CI71 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vps50Q8CI71 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vps50Q8CI71 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vps50Q8CI71 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vps50Q8CI71 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vps50Q8CI71 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vps50Q8CI71 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vps50Q8CI71 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vps50Q8CI71 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vps50Q8CI71 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms