Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGR7

Upp2, Uridine phosphorylase 2, mousemouse

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Length 320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp2Q8CGR7 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Upp2Q8CGR7 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Upp2Q8CGR7 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Upp2Q8CGR7 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Upp2Q8CGR7 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Upp2Q8CGR7 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Upp2Q8CGR7 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Upp2Q8CGR7 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Upp2Q8CGR7 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Upp2Q8CGR7 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Upp2Q8CGR7 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Upp2Q8CGR7 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Upp2Q8CGR7 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Upp2Q8CGR7 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Upp2Q8CGR7 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Upp2Q8CGR7 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Upp2Q8CGR7 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Upp2Q8CGR7 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Upp2Q8CGR7 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Upp2Q8CGR7 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Upp2Q8CGR7 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Upp2Q8CGR7 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Upp2Q8CGR7 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Upp2Q8CGR7 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Upp2Q8CGR7 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Upp2Q8CGR7 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Upp2Q8CGR7 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Upp2Q8CGR7 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Upp2Q8CGR7 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Upp2Q8CGR7 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Upp2Q8CGR7 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Upp2Q8CGR7 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Upp2Q8CGR7 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Upp2Q8CGR7 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Upp2Q8CGR7 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Upp2Q8CGR7 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Upp2Q8CGR7 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Upp2Q8CGR7 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Upp2Q8CGR7 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Upp2Q8CGR7 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Upp2Q8CGR7 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Upp2Q8CGR7 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Upp2Q8CGR7 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Upp2Q8CGR7 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Upp2Q8CGR7 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Upp2Q8CGR7 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Upp2Q8CGR7 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Upp2Q8CGR7 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Upp2Q8CGR7 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Upp2Q8CGR7 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Upp2Q8CGR7 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Upp2Q8CGR7 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Upp2Q8CGR7 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Upp2Q8CGR7 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Upp2Q8CGR7 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Upp2Q8CGR7 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Upp2Q8CGR7 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Upp2Q8CGR7 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Upp2Q8CGR7 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Upp2Q8CGR7 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Upp2Q8CGR7 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Upp2Q8CGR7 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Upp2Q8CGR7 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Upp2Q8CGR7 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Upp2Q8CGR7 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Upp2Q8CGR7 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Upp2Q8CGR7 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Upp2Q8CGR7 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Upp2Q8CGR7 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Upp2Q8CGR7 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Upp2Q8CGR7 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Upp2Q8CGR7 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Upp2Q8CGR7 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Upp2Q8CGR7 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Upp2Q8CGR7 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Upp2Q8CGR7 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Upp2Q8CGR7 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Upp2Q8CGR7 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Upp2Q8CGR7 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Upp2Q8CGR7 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Upp2Q8CGR7 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Upp2Q8CGR7 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Upp2Q8CGR7 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Upp2Q8CGR7 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Upp2Q8CGR7 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Upp2Q8CGR7 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Upp2Q8CGR7 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Upp2Q8CGR7 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Upp2Q8CGR7 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Upp2Q8CGR7 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Upp2Q8CGR7 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Upp2Q8CGR7 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Upp2Q8CGR7 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Upp2Q8CGR7 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Upp2Q8CGR7 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Upp2Q8CGR7 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Upp2Q8CGR7 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Upp2Q8CGR7 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Upp2Q8CGR7 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Upp2Q8CGR7 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms