Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI3

Ccdc28a, Coiled-coil domain-containing 28A, mousemouse

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Length 192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28aQ8CEI3 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc28aQ8CEI3 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc28aQ8CEI3 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc28aQ8CEI3 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc28aQ8CEI3 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc28aQ8CEI3 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc28aQ8CEI3 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc28aQ8CEI3 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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