Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDL9

Ccdc87, Coiled-coil domain-containing protein 87, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc87Q8CDL9 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc87Q8CDL9 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc87Q8CDL9 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc87Q8CDL9 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc87Q8CDL9 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc87Q8CDL9 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc87Q8CDL9 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc87Q8CDL9 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc87Q8CDL9 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc87Q8CDL9 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc87Q8CDL9 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc87Q8CDL9 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc87Q8CDL9 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc87Q8CDL9 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc87Q8CDL9 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc87Q8CDL9 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc87Q8CDL9 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc87Q8CDL9 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc87Q8CDL9 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc87Q8CDL9 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc87Q8CDL9 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc87Q8CDL9 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc87Q8CDL9 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc87Q8CDL9 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc87Q8CDL9 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc87Q8CDL9 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc87Q8CDL9 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc87Q8CDL9 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc87Q8CDL9 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc87Q8CDL9 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc87Q8CDL9 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc87Q8CDL9 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc87Q8CDL9 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc87Q8CDL9 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc87Q8CDL9 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc87Q8CDL9 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc87Q8CDL9 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc87Q8CDL9 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc87Q8CDL9 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc87Q8CDL9 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc87Q8CDL9 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc87Q8CDL9 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc87Q8CDL9 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc87Q8CDL9 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc87Q8CDL9 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc87Q8CDL9 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc87Q8CDL9 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms