Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDE2

Ccin, Calicin, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcinQ8CDE2 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CcinQ8CDE2 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CcinQ8CDE2 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CcinQ8CDE2 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CcinQ8CDE2 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CcinQ8CDE2 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CcinQ8CDE2 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CcinQ8CDE2 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CcinQ8CDE2 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CcinQ8CDE2 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CcinQ8CDE2 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CcinQ8CDE2 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CcinQ8CDE2 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CcinQ8CDE2 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CcinQ8CDE2 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CcinQ8CDE2 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CcinQ8CDE2 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CcinQ8CDE2 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CcinQ8CDE2 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CcinQ8CDE2 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CcinQ8CDE2 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CcinQ8CDE2 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CcinQ8CDE2 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CcinQ8CDE2 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CcinQ8CDE2 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CcinQ8CDE2 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CcinQ8CDE2 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CcinQ8CDE2 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CcinQ8CDE2 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CcinQ8CDE2 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CcinQ8CDE2 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CcinQ8CDE2 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CcinQ8CDE2 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CcinQ8CDE2 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CcinQ8CDE2 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CcinQ8CDE2 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CcinQ8CDE2 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CcinQ8CDE2 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CcinQ8CDE2 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CcinQ8CDE2 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CcinQ8CDE2 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CcinQ8CDE2 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CcinQ8CDE2 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CcinQ8CDE2 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CcinQ8CDE2 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CcinQ8CDE2 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CcinQ8CDE2 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CcinQ8CDE2 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CcinQ8CDE2 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CcinQ8CDE2 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CcinQ8CDE2 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CcinQ8CDE2 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CcinQ8CDE2 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CcinQ8CDE2 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CcinQ8CDE2 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CcinQ8CDE2 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CcinQ8CDE2 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CcinQ8CDE2 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CcinQ8CDE2 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CcinQ8CDE2 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CcinQ8CDE2 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CcinQ8CDE2 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CcinQ8CDE2 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CcinQ8CDE2 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CcinQ8CDE2 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CcinQ8CDE2 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CcinQ8CDE2 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CcinQ8CDE2 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CcinQ8CDE2 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CcinQ8CDE2 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CcinQ8CDE2 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CcinQ8CDE2 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CcinQ8CDE2 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CcinQ8CDE2 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CcinQ8CDE2 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CcinQ8CDE2 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CcinQ8CDE2 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CcinQ8CDE2 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CcinQ8CDE2 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CcinQ8CDE2 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CcinQ8CDE2 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CcinQ8CDE2 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CcinQ8CDE2 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CcinQ8CDE2 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CcinQ8CDE2 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CcinQ8CDE2 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CcinQ8CDE2 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CcinQ8CDE2 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CcinQ8CDE2 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CcinQ8CDE2 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CcinQ8CDE2 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CcinQ8CDE2 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CcinQ8CDE2 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CcinQ8CDE2 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CcinQ8CDE2 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CcinQ8CDE2 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CcinQ8CDE2 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CcinQ8CDE2 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CcinQ8CDE2 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CcinQ8CDE2 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms