Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCT7

Nsun3, tRNA (cytosine(34)-C(5))-methyltransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsun3Q8CCT7 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nsun3Q8CCT7 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Nsun3Q8CCT7 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nsun3Q8CCT7 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nsun3Q8CCT7 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nsun3Q8CCT7 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nsun3Q8CCT7 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nsun3Q8CCT7 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nsun3Q8CCT7 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nsun3Q8CCT7 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nsun3Q8CCT7 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nsun3Q8CCT7 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nsun3Q8CCT7 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nsun3Q8CCT7 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nsun3Q8CCT7 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nsun3Q8CCT7 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nsun3Q8CCT7 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nsun3Q8CCT7 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nsun3Q8CCT7 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nsun3Q8CCT7 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nsun3Q8CCT7 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nsun3Q8CCT7 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nsun3Q8CCT7 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nsun3Q8CCT7 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nsun3Q8CCT7 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nsun3Q8CCT7 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nsun3Q8CCT7 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nsun3Q8CCT7 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nsun3Q8CCT7 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nsun3Q8CCT7 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nsun3Q8CCT7 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nsun3Q8CCT7 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nsun3Q8CCT7 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nsun3Q8CCT7 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nsun3Q8CCT7 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nsun3Q8CCT7 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nsun3Q8CCT7 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nsun3Q8CCT7 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nsun3Q8CCT7 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nsun3Q8CCT7 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nsun3Q8CCT7 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nsun3Q8CCT7 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nsun3Q8CCT7 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nsun3Q8CCT7 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nsun3Q8CCT7 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nsun3Q8CCT7 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nsun3Q8CCT7 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nsun3Q8CCT7 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nsun3Q8CCT7 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nsun3Q8CCT7 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nsun3Q8CCT7 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nsun3Q8CCT7 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nsun3Q8CCT7 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nsun3Q8CCT7 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nsun3Q8CCT7 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nsun3Q8CCT7 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nsun3Q8CCT7 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nsun3Q8CCT7 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nsun3Q8CCT7 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nsun3Q8CCT7 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nsun3Q8CCT7 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nsun3Q8CCT7 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nsun3Q8CCT7 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nsun3Q8CCT7 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nsun3Q8CCT7 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nsun3Q8CCT7 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nsun3Q8CCT7 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nsun3Q8CCT7 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nsun3Q8CCT7 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nsun3Q8CCT7 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nsun3Q8CCT7 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nsun3Q8CCT7 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nsun3Q8CCT7 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nsun3Q8CCT7 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nsun3Q8CCT7 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nsun3Q8CCT7 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nsun3Q8CCT7 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nsun3Q8CCT7 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nsun3Q8CCT7 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nsun3Q8CCT7 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nsun3Q8CCT7 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nsun3Q8CCT7 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nsun3Q8CCT7 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nsun3Q8CCT7 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nsun3Q8CCT7 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nsun3Q8CCT7 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nsun3Q8CCT7 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nsun3Q8CCT7 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nsun3Q8CCT7 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nsun3Q8CCT7 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nsun3Q8CCT7 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nsun3Q8CCT7 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nsun3Q8CCT7 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nsun3Q8CCT7 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nsun3Q8CCT7 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nsun3Q8CCT7 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nsun3Q8CCT7 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nsun3Q8CCT7 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nsun3Q8CCT7 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nsun3Q8CCT7 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms