Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCE9

E4f1, Transcription factor E4F1, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E4f1Q8CCE9 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
E4f1Q8CCE9 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
E4f1Q8CCE9 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
E4f1Q8CCE9 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
E4f1Q8CCE9 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
E4f1Q8CCE9 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
E4f1Q8CCE9 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
E4f1Q8CCE9 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
E4f1Q8CCE9 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
E4f1Q8CCE9 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
E4f1Q8CCE9 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
E4f1Q8CCE9 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
E4f1Q8CCE9 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
E4f1Q8CCE9 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
E4f1Q8CCE9 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
E4f1Q8CCE9 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
E4f1Q8CCE9 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
E4f1Q8CCE9 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
E4f1Q8CCE9 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
E4f1Q8CCE9 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
E4f1Q8CCE9 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
E4f1Q8CCE9 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
E4f1Q8CCE9 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
E4f1Q8CCE9 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
E4f1Q8CCE9 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
E4f1Q8CCE9 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
E4f1Q8CCE9 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
E4f1Q8CCE9 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
E4f1Q8CCE9 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
E4f1Q8CCE9 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
E4f1Q8CCE9 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
E4f1Q8CCE9 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
E4f1Q8CCE9 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
E4f1Q8CCE9 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
E4f1Q8CCE9 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
E4f1Q8CCE9 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
E4f1Q8CCE9 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
E4f1Q8CCE9 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
E4f1Q8CCE9 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
E4f1Q8CCE9 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
E4f1Q8CCE9 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
E4f1Q8CCE9 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
E4f1Q8CCE9 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
E4f1Q8CCE9 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
E4f1Q8CCE9 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
E4f1Q8CCE9 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
E4f1Q8CCE9 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
E4f1Q8CCE9 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
E4f1Q8CCE9 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
E4f1Q8CCE9 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
E4f1Q8CCE9 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
E4f1Q8CCE9 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
E4f1Q8CCE9 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
E4f1Q8CCE9 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
E4f1Q8CCE9 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
E4f1Q8CCE9 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
E4f1Q8CCE9 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
E4f1Q8CCE9 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
E4f1Q8CCE9 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
E4f1Q8CCE9 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
E4f1Q8CCE9 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
E4f1Q8CCE9 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
E4f1Q8CCE9 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
E4f1Q8CCE9 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
E4f1Q8CCE9 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
E4f1Q8CCE9 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
E4f1Q8CCE9 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
E4f1Q8CCE9 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
E4f1Q8CCE9 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
E4f1Q8CCE9 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
E4f1Q8CCE9 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
E4f1Q8CCE9 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
E4f1Q8CCE9 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
E4f1Q8CCE9 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
E4f1Q8CCE9 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
E4f1Q8CCE9 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
E4f1Q8CCE9 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
E4f1Q8CCE9 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
E4f1Q8CCE9 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
E4f1Q8CCE9 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
E4f1Q8CCE9 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
E4f1Q8CCE9 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
E4f1Q8CCE9 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
E4f1Q8CCE9 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
E4f1Q8CCE9 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
E4f1Q8CCE9 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
E4f1Q8CCE9 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
E4f1Q8CCE9 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
E4f1Q8CCE9 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
E4f1Q8CCE9 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
E4f1Q8CCE9 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
E4f1Q8CCE9 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
E4f1Q8CCE9 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
E4f1Q8CCE9 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
E4f1Q8CCE9 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
E4f1Q8CCE9 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
E4f1Q8CCE9 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
E4f1Q8CCE9 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
E4f1Q8CCE9 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
E4f1Q8CCE9 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms