Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBD1

Nrip1, Nuclear receptor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrip1Q8CBD1 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Nrip1Q8CBD1 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nrip1Q8CBD1 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nrip1Q8CBD1 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nrip1Q8CBD1 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nrip1Q8CBD1 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nrip1Q8CBD1 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nrip1Q8CBD1 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nrip1Q8CBD1 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nrip1Q8CBD1 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nrip1Q8CBD1 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nrip1Q8CBD1 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nrip1Q8CBD1 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nrip1Q8CBD1 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nrip1Q8CBD1 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nrip1Q8CBD1 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nrip1Q8CBD1 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nrip1Q8CBD1 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nrip1Q8CBD1 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nrip1Q8CBD1 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nrip1Q8CBD1 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nrip1Q8CBD1 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nrip1Q8CBD1 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nrip1Q8CBD1 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nrip1Q8CBD1 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nrip1Q8CBD1 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nrip1Q8CBD1 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nrip1Q8CBD1 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nrip1Q8CBD1 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nrip1Q8CBD1 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nrip1Q8CBD1 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nrip1Q8CBD1 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nrip1Q8CBD1 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nrip1Q8CBD1 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nrip1Q8CBD1 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nrip1Q8CBD1 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Nrip1Q8CBD1 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nrip1Q8CBD1 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nrip1Q8CBD1 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nrip1Q8CBD1 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nrip1Q8CBD1 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nrip1Q8CBD1 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nrip1Q8CBD1 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nrip1Q8CBD1 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nrip1Q8CBD1 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nrip1Q8CBD1 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nrip1Q8CBD1 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nrip1Q8CBD1 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nrip1Q8CBD1 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nrip1Q8CBD1 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Nrip1Q8CBD1 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nrip1Q8CBD1 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nrip1Q8CBD1 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nrip1Q8CBD1 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nrip1Q8CBD1 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nrip1Q8CBD1 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nrip1Q8CBD1 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nrip1Q8CBD1 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nrip1Q8CBD1 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nrip1Q8CBD1 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Nrip1Q8CBD1 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Nrip1Q8CBD1 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Nrip1Q8CBD1 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Nrip1Q8CBD1 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nrip1Q8CBD1 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nrip1Q8CBD1 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Nrip1Q8CBD1 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nrip1Q8CBD1 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nrip1Q8CBD1 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nrip1Q8CBD1 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nrip1Q8CBD1 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nrip1Q8CBD1 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nrip1Q8CBD1 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nrip1Q8CBD1 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nrip1Q8CBD1 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nrip1Q8CBD1 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Nrip1Q8CBD1 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nrip1Q8CBD1 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nrip1Q8CBD1 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nrip1Q8CBD1 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Nrip1Q8CBD1 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Nrip1Q8CBD1 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nrip1Q8CBD1 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nrip1Q8CBD1 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nrip1Q8CBD1 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nrip1Q8CBD1 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nrip1Q8CBD1 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nrip1Q8CBD1 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nrip1Q8CBD1 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nrip1Q8CBD1 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nrip1Q8CBD1 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nrip1Q8CBD1 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nrip1Q8CBD1 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nrip1Q8CBD1 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nrip1Q8CBD1 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nrip1Q8CBD1 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nrip1Q8CBD1 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nrip1Q8CBD1 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nrip1Q8CBD1 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nrip1Q8CBD1 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms