Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVA4

Lmod1, Leiomodin-1, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod1Q8BVA4 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lmod1Q8BVA4 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lmod1Q8BVA4 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lmod1Q8BVA4 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Lmod1Q8BVA4 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lmod1Q8BVA4 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lmod1Q8BVA4 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lmod1Q8BVA4 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lmod1Q8BVA4 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lmod1Q8BVA4 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lmod1Q8BVA4 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lmod1Q8BVA4 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lmod1Q8BVA4 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lmod1Q8BVA4 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lmod1Q8BVA4 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lmod1Q8BVA4 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Lmod1Q8BVA4 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lmod1Q8BVA4 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lmod1Q8BVA4 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lmod1Q8BVA4 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lmod1Q8BVA4 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lmod1Q8BVA4 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lmod1Q8BVA4 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lmod1Q8BVA4 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lmod1Q8BVA4 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lmod1Q8BVA4 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lmod1Q8BVA4 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lmod1Q8BVA4 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmod1Q8BVA4 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmod1Q8BVA4 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmod1Q8BVA4 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmod1Q8BVA4 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmod1Q8BVA4 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmod1Q8BVA4 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmod1Q8BVA4 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmod1Q8BVA4 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmod1Q8BVA4 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmod1Q8BVA4 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmod1Q8BVA4 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmod1Q8BVA4 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmod1Q8BVA4 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmod1Q8BVA4 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmod1Q8BVA4 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmod1Q8BVA4 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmod1Q8BVA4 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmod1Q8BVA4 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmod1Q8BVA4 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmod1Q8BVA4 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmod1Q8BVA4 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmod1Q8BVA4 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmod1Q8BVA4 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmod1Q8BVA4 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmod1Q8BVA4 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmod1Q8BVA4 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmod1Q8BVA4 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmod1Q8BVA4 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmod1Q8BVA4 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmod1Q8BVA4 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmod1Q8BVA4 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmod1Q8BVA4 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmod1Q8BVA4 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmod1Q8BVA4 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmod1Q8BVA4 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmod1Q8BVA4 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmod1Q8BVA4 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmod1Q8BVA4 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmod1Q8BVA4 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmod1Q8BVA4 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmod1Q8BVA4 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmod1Q8BVA4 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmod1Q8BVA4 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmod1Q8BVA4 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmod1Q8BVA4 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmod1Q8BVA4 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmod1Q8BVA4 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmod1Q8BVA4 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmod1Q8BVA4 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmod1Q8BVA4 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmod1Q8BVA4 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lmod1Q8BVA4 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lmod1Q8BVA4 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lmod1Q8BVA4 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lmod1Q8BVA4 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lmod1Q8BVA4 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lmod1Q8BVA4 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lmod1Q8BVA4 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lmod1Q8BVA4 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lmod1Q8BVA4 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lmod1Q8BVA4 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lmod1Q8BVA4 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lmod1Q8BVA4 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lmod1Q8BVA4 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lmod1Q8BVA4 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lmod1Q8BVA4 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lmod1Q8BVA4 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lmod1Q8BVA4 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lmod1Q8BVA4 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lmod1Q8BVA4 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lmod1Q8BVA4 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lmod1Q8BVA4 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms