Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI3

Gga3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga3Q8BMI3 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gga3Q8BMI3 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gga3Q8BMI3 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gga3Q8BMI3 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gga3Q8BMI3 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gga3Q8BMI3 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gga3Q8BMI3 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Gga3Q8BMI3 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gga3Q8BMI3 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gga3Q8BMI3 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gga3Q8BMI3 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gga3Q8BMI3 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gga3Q8BMI3 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gga3Q8BMI3 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gga3Q8BMI3 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gga3Q8BMI3 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gga3Q8BMI3 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Gga3Q8BMI3 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gga3Q8BMI3 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gga3Q8BMI3 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gga3Q8BMI3 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gga3Q8BMI3 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gga3Q8BMI3 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gga3Q8BMI3 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gga3Q8BMI3 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gga3Q8BMI3 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gga3Q8BMI3 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gga3Q8BMI3 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gga3Q8BMI3 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gga3Q8BMI3 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gga3Q8BMI3 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gga3Q8BMI3 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gga3Q8BMI3 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gga3Q8BMI3 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gga3Q8BMI3 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gga3Q8BMI3 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gga3Q8BMI3 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gga3Q8BMI3 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gga3Q8BMI3 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gga3Q8BMI3 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gga3Q8BMI3 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gga3Q8BMI3 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gga3Q8BMI3 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gga3Q8BMI3 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gga3Q8BMI3 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gga3Q8BMI3 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gga3Q8BMI3 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gga3Q8BMI3 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gga3Q8BMI3 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gga3Q8BMI3 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gga3Q8BMI3 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gga3Q8BMI3 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gga3Q8BMI3 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gga3Q8BMI3 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Gga3Q8BMI3 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Gga3Q8BMI3 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Gga3Q8BMI3 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gga3Q8BMI3 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gga3Q8BMI3 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gga3Q8BMI3 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gga3Q8BMI3 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gga3Q8BMI3 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gga3Q8BMI3 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gga3Q8BMI3 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gga3Q8BMI3 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gga3Q8BMI3 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gga3Q8BMI3 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gga3Q8BMI3 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gga3Q8BMI3 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gga3Q8BMI3 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gga3Q8BMI3 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gga3Q8BMI3 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gga3Q8BMI3 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gga3Q8BMI3 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gga3Q8BMI3 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gga3Q8BMI3 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gga3Q8BMI3 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Gga3Q8BMI3 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gga3Q8BMI3 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Gga3Q8BMI3 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Gga3Q8BMI3 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gga3Q8BMI3 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gga3Q8BMI3 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gga3Q8BMI3 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Gga3Q8BMI3 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gga3Q8BMI3 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gga3Q8BMI3 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gga3Q8BMI3 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Gga3Q8BMI3 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Gga3Q8BMI3 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gga3Q8BMI3 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gga3Q8BMI3 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gga3Q8BMI3 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Gga3Q8BMI3 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gga3Q8BMI3 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gga3Q8BMI3 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gga3Q8BMI3 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gga3Q8BMI3 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gga3Q8BMI3 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gga3Q8BMI3 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms