Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJ71

Nup93, Nuclear pore complex protein Nup93, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 819 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup93Q8BJ71 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nup93Q8BJ71 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Nup93Q8BJ71 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nup93Q8BJ71 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Nup93Q8BJ71 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nup93Q8BJ71 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nup93Q8BJ71 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nup93Q8BJ71 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nup93Q8BJ71 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nup93Q8BJ71 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nup93Q8BJ71 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nup93Q8BJ71 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nup93Q8BJ71 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nup93Q8BJ71 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nup93Q8BJ71 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nup93Q8BJ71 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nup93Q8BJ71 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nup93Q8BJ71 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nup93Q8BJ71 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nup93Q8BJ71 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nup93Q8BJ71 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nup93Q8BJ71 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nup93Q8BJ71 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nup93Q8BJ71 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Nup93Q8BJ71 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nup93Q8BJ71 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Nup93Q8BJ71 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Nup93Q8BJ71 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Nup93Q8BJ71 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Nup93Q8BJ71 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nup93Q8BJ71 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nup93Q8BJ71 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nup93Q8BJ71 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nup93Q8BJ71 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nup93Q8BJ71 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nup93Q8BJ71 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nup93Q8BJ71 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nup93Q8BJ71 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nup93Q8BJ71 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nup93Q8BJ71 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nup93Q8BJ71 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nup93Q8BJ71 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nup93Q8BJ71 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nup93Q8BJ71 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nup93Q8BJ71 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nup93Q8BJ71 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nup93Q8BJ71 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nup93Q8BJ71 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nup93Q8BJ71 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nup93Q8BJ71 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nup93Q8BJ71 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nup93Q8BJ71 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nup93Q8BJ71 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nup93Q8BJ71 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nup93Q8BJ71 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nup93Q8BJ71 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Nup93Q8BJ71 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Nup93Q8BJ71 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Nup93Q8BJ71 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nup93Q8BJ71 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nup93Q8BJ71 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nup93Q8BJ71 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nup93Q8BJ71 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nup93Q8BJ71 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nup93Q8BJ71 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nup93Q8BJ71 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nup93Q8BJ71 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nup93Q8BJ71 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nup93Q8BJ71 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nup93Q8BJ71 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nup93Q8BJ71 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nup93Q8BJ71 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nup93Q8BJ71 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nup93Q8BJ71 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nup93Q8BJ71 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Nup93Q8BJ71 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Nup93Q8BJ71 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nup93Q8BJ71 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nup93Q8BJ71 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nup93Q8BJ71 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nup93Q8BJ71 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nup93Q8BJ71 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nup93Q8BJ71 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nup93Q8BJ71 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nup93Q8BJ71 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nup93Q8BJ71 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nup93Q8BJ71 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nup93Q8BJ71 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nup93Q8BJ71 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nup93Q8BJ71 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nup93Q8BJ71 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nup93Q8BJ71 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nup93Q8BJ71 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nup93Q8BJ71 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nup93Q8BJ71 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nup93Q8BJ71 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nup93Q8BJ71 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nup93Q8BJ71 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nup93Q8BJ71 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nup93Q8BJ71 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms