Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGF0

AW551984, Expressed sequence AW551984, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AW551984Q8BGF0 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AW551984Q8BGF0 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AW551984Q8BGF0 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AW551984Q8BGF0 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
AW551984Q8BGF0 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AW551984Q8BGF0 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AW551984Q8BGF0 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AW551984Q8BGF0 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
AW551984Q8BGF0 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AW551984Q8BGF0 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AW551984Q8BGF0 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
AW551984Q8BGF0 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
AW551984Q8BGF0 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
AW551984Q8BGF0 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AW551984Q8BGF0 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
AW551984Q8BGF0 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AW551984Q8BGF0 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AW551984Q8BGF0 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AW551984Q8BGF0 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AW551984Q8BGF0 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AW551984Q8BGF0 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AW551984Q8BGF0 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
AW551984Q8BGF0 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AW551984Q8BGF0 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AW551984Q8BGF0 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AW551984Q8BGF0 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AW551984Q8BGF0 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AW551984Q8BGF0 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AW551984Q8BGF0 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AW551984Q8BGF0 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AW551984Q8BGF0 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AW551984Q8BGF0 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AW551984Q8BGF0 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AW551984Q8BGF0 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AW551984Q8BGF0 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AW551984Q8BGF0 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AW551984Q8BGF0 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AW551984Q8BGF0 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AW551984Q8BGF0 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AW551984Q8BGF0 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AW551984Q8BGF0 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AW551984Q8BGF0 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AW551984Q8BGF0 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AW551984Q8BGF0 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AW551984Q8BGF0 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AW551984Q8BGF0 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AW551984Q8BGF0 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AW551984Q8BGF0 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AW551984Q8BGF0 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AW551984Q8BGF0 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AW551984Q8BGF0 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AW551984Q8BGF0 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AW551984Q8BGF0 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AW551984Q8BGF0 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AW551984Q8BGF0 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AW551984Q8BGF0 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AW551984Q8BGF0 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AW551984Q8BGF0 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AW551984Q8BGF0 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AW551984Q8BGF0 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AW551984Q8BGF0 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AW551984Q8BGF0 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AW551984Q8BGF0 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AW551984Q8BGF0 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
AW551984Q8BGF0 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AW551984Q8BGF0 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
AW551984Q8BGF0 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AW551984Q8BGF0 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
AW551984Q8BGF0 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AW551984Q8BGF0 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AW551984Q8BGF0 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AW551984Q8BGF0 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AW551984Q8BGF0 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AW551984Q8BGF0 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AW551984Q8BGF0 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AW551984Q8BGF0 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AW551984Q8BGF0 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AW551984Q8BGF0 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AW551984Q8BGF0 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AW551984Q8BGF0 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AW551984Q8BGF0 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AW551984Q8BGF0 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AW551984Q8BGF0 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AW551984Q8BGF0 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AW551984Q8BGF0 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AW551984Q8BGF0 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AW551984Q8BGF0 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AW551984Q8BGF0 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AW551984Q8BGF0 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AW551984Q8BGF0 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
AW551984Q8BGF0 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
AW551984Q8BGF0 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AW551984Q8BGF0 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AW551984Q8BGF0 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AW551984Q8BGF0 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AW551984Q8BGF0 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
AW551984Q8BGF0 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
AW551984Q8BGF0 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AW551984Q8BGF0 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AW551984Q8BGF0 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms