Protein–RNA interactions for Protein: Q80Y84

Kdm5b, Lysine-specific demethylase 5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5bQ80Y84 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Kdm5bQ80Y84 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Kdm5bQ80Y84 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Kdm5bQ80Y84 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Kdm5bQ80Y84 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Kdm5bQ80Y84 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Kdm5bQ80Y84 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Kdm5bQ80Y84 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Kdm5bQ80Y84 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Kdm5bQ80Y84 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Kdm5bQ80Y84 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Kdm5bQ80Y84 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Kdm5bQ80Y84 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Kdm5bQ80Y84 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Kdm5bQ80Y84 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Kdm5bQ80Y84 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Kdm5bQ80Y84 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Kdm5bQ80Y84 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Kdm5bQ80Y84 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Kdm5bQ80Y84 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Kdm5bQ80Y84 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Kdm5bQ80Y84 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Kdm5bQ80Y84 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Kdm5bQ80Y84 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Kdm5bQ80Y84 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Kdm5bQ80Y84 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Kdm5bQ80Y84 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Kdm5bQ80Y84 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Kdm5bQ80Y84 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Kdm5bQ80Y84 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Kdm5bQ80Y84 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Kdm5bQ80Y84 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Kdm5bQ80Y84 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Kdm5bQ80Y84 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Kdm5bQ80Y84 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Kdm5bQ80Y84 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Kdm5bQ80Y84 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Kdm5bQ80Y84 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Kdm5bQ80Y84 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Kdm5bQ80Y84 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Kdm5bQ80Y84 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Kdm5bQ80Y84 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Kdm5bQ80Y84 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Kdm5bQ80Y84 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Kdm5bQ80Y84 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Kdm5bQ80Y84 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Kdm5bQ80Y84 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Kdm5bQ80Y84 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Kdm5bQ80Y84 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Kdm5bQ80Y84 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Kdm5bQ80Y84 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Kdm5bQ80Y84 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Kdm5bQ80Y84 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Kdm5bQ80Y84 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Kdm5bQ80Y84 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Kdm5bQ80Y84 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Kdm5bQ80Y84 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Kdm5bQ80Y84 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Kdm5bQ80Y84 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Kdm5bQ80Y84 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Kdm5bQ80Y84 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Kdm5bQ80Y84 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Kdm5bQ80Y84 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Kdm5bQ80Y84 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Kdm5bQ80Y84 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Kdm5bQ80Y84 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Kdm5bQ80Y84 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Kdm5bQ80Y84 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Kdm5bQ80Y84 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Kdm5bQ80Y84 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Kdm5bQ80Y84 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Kdm5bQ80Y84 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Kdm5bQ80Y84 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Kdm5bQ80Y84 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Kdm5bQ80Y84 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Kdm5bQ80Y84 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Kdm5bQ80Y84 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Kdm5bQ80Y84 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Kdm5bQ80Y84 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Kdm5bQ80Y84 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Kdm5bQ80Y84 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Kdm5bQ80Y84 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Kdm5bQ80Y84 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Kdm5bQ80Y84 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Kdm5bQ80Y84 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Kdm5bQ80Y84 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Kdm5bQ80Y84 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Kdm5bQ80Y84 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Kdm5bQ80Y84 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Kdm5bQ80Y84 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Kdm5bQ80Y84 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Kdm5bQ80Y84 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Kdm5bQ80Y84 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Kdm5bQ80Y84 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Kdm5bQ80Y84 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Kdm5bQ80Y84 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Kdm5bQ80Y84 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Kdm5bQ80Y84 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Kdm5bQ80Y84 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Kdm5bQ80Y84 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms