Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM8

Pnma8a, Paraneoplastic antigen-like protein 8A, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma8aQ80VM8 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pnma8aQ80VM8 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Pnma8aQ80VM8 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
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Pnma8aQ80VM8 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Pnma8aQ80VM8 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pnma8aQ80VM8 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms