Protein–RNA interactions for Protein: Q7TST5

Lamp3, Lysosome-associated membrane glycoprotein 3, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp3Q7TST5 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Lamp3Q7TST5 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lamp3Q7TST5 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lamp3Q7TST5 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lamp3Q7TST5 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lamp3Q7TST5 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lamp3Q7TST5 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lamp3Q7TST5 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lamp3Q7TST5 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lamp3Q7TST5 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lamp3Q7TST5 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lamp3Q7TST5 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lamp3Q7TST5 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lamp3Q7TST5 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lamp3Q7TST5 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lamp3Q7TST5 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lamp3Q7TST5 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lamp3Q7TST5 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lamp3Q7TST5 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Lamp3Q7TST5 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lamp3Q7TST5 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lamp3Q7TST5 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lamp3Q7TST5 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lamp3Q7TST5 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lamp3Q7TST5 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Lamp3Q7TST5 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lamp3Q7TST5 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lamp3Q7TST5 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lamp3Q7TST5 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lamp3Q7TST5 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lamp3Q7TST5 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lamp3Q7TST5 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lamp3Q7TST5 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lamp3Q7TST5 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lamp3Q7TST5 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lamp3Q7TST5 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lamp3Q7TST5 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lamp3Q7TST5 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lamp3Q7TST5 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lamp3Q7TST5 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lamp3Q7TST5 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lamp3Q7TST5 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lamp3Q7TST5 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lamp3Q7TST5 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lamp3Q7TST5 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lamp3Q7TST5 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lamp3Q7TST5 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lamp3Q7TST5 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lamp3Q7TST5 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lamp3Q7TST5 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lamp3Q7TST5 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lamp3Q7TST5 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lamp3Q7TST5 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lamp3Q7TST5 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lamp3Q7TST5 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lamp3Q7TST5 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lamp3Q7TST5 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lamp3Q7TST5 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lamp3Q7TST5 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lamp3Q7TST5 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lamp3Q7TST5 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lamp3Q7TST5 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lamp3Q7TST5 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lamp3Q7TST5 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lamp3Q7TST5 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lamp3Q7TST5 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lamp3Q7TST5 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lamp3Q7TST5 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lamp3Q7TST5 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lamp3Q7TST5 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lamp3Q7TST5 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lamp3Q7TST5 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lamp3Q7TST5 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lamp3Q7TST5 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lamp3Q7TST5 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lamp3Q7TST5 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lamp3Q7TST5 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lamp3Q7TST5 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lamp3Q7TST5 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lamp3Q7TST5 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lamp3Q7TST5 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Lamp3Q7TST5 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lamp3Q7TST5 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lamp3Q7TST5 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lamp3Q7TST5 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lamp3Q7TST5 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lamp3Q7TST5 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lamp3Q7TST5 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lamp3Q7TST5 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lamp3Q7TST5 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lamp3Q7TST5 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lamp3Q7TST5 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lamp3Q7TST5 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lamp3Q7TST5 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lamp3Q7TST5 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lamp3Q7TST5 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lamp3Q7TST5 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lamp3Q7TST5 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lamp3Q7TST5 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lamp3Q7TST5 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms