Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSS2

Ube2q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q1Q7TSS2 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ube2q1Q7TSS2 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ube2q1Q7TSS2 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ube2q1Q7TSS2 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ube2q1Q7TSS2 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ube2q1Q7TSS2 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ube2q1Q7TSS2 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ube2q1Q7TSS2 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ube2q1Q7TSS2 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ube2q1Q7TSS2 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ube2q1Q7TSS2 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ube2q1Q7TSS2 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ube2q1Q7TSS2 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ube2q1Q7TSS2 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ube2q1Q7TSS2 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ube2q1Q7TSS2 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ube2q1Q7TSS2 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ube2q1Q7TSS2 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ube2q1Q7TSS2 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ube2q1Q7TSS2 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ube2q1Q7TSS2 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ube2q1Q7TSS2 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ube2q1Q7TSS2 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ube2q1Q7TSS2 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ube2q1Q7TSS2 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ube2q1Q7TSS2 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ube2q1Q7TSS2 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ube2q1Q7TSS2 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ube2q1Q7TSS2 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ube2q1Q7TSS2 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ube2q1Q7TSS2 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ube2q1Q7TSS2 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ube2q1Q7TSS2 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ube2q1Q7TSS2 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ube2q1Q7TSS2 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ube2q1Q7TSS2 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ube2q1Q7TSS2 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ube2q1Q7TSS2 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ube2q1Q7TSS2 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ube2q1Q7TSS2 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ube2q1Q7TSS2 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ube2q1Q7TSS2 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ube2q1Q7TSS2 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ube2q1Q7TSS2 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ube2q1Q7TSS2 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ube2q1Q7TSS2 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ube2q1Q7TSS2 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ube2q1Q7TSS2 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ube2q1Q7TSS2 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ube2q1Q7TSS2 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ube2q1Q7TSS2 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ube2q1Q7TSS2 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Ube2q1Q7TSS2 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ube2q1Q7TSS2 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ube2q1Q7TSS2 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ube2q1Q7TSS2 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ube2q1Q7TSS2 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ube2q1Q7TSS2 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ube2q1Q7TSS2 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Ube2q1Q7TSS2 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ube2q1Q7TSS2 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ube2q1Q7TSS2 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ube2q1Q7TSS2 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Ube2q1Q7TSS2 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ube2q1Q7TSS2 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ube2q1Q7TSS2 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ube2q1Q7TSS2 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ube2q1Q7TSS2 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ube2q1Q7TSS2 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ube2q1Q7TSS2 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ube2q1Q7TSS2 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ube2q1Q7TSS2 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ube2q1Q7TSS2 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ube2q1Q7TSS2 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ube2q1Q7TSS2 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ube2q1Q7TSS2 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ube2q1Q7TSS2 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ube2q1Q7TSS2 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ube2q1Q7TSS2 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ube2q1Q7TSS2 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ube2q1Q7TSS2 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ube2q1Q7TSS2 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ube2q1Q7TSS2 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ube2q1Q7TSS2 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ube2q1Q7TSS2 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ube2q1Q7TSS2 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ube2q1Q7TSS2 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ube2q1Q7TSS2 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ube2q1Q7TSS2 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ube2q1Q7TSS2 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ube2q1Q7TSS2 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ube2q1Q7TSS2 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ube2q1Q7TSS2 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ube2q1Q7TSS2 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ube2q1Q7TSS2 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ube2q1Q7TSS2 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ube2q1Q7TSS2 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ube2q1Q7TSS2 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ube2q1Q7TSS2 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ube2q1Q7TSS2 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms