Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prrc2bQ7TPM1 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prrc2bQ7TPM1 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prrc2bQ7TPM1 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prrc2bQ7TPM1 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prrc2bQ7TPM1 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Prrc2bQ7TPM1 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prrc2bQ7TPM1 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prrc2bQ7TPM1 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prrc2bQ7TPM1 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prrc2bQ7TPM1 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prrc2bQ7TPM1 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Prrc2bQ7TPM1 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Prrc2bQ7TPM1 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prrc2bQ7TPM1 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prrc2bQ7TPM1 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prrc2bQ7TPM1 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prrc2bQ7TPM1 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prrc2bQ7TPM1 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prrc2bQ7TPM1 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prrc2bQ7TPM1 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prrc2bQ7TPM1 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prrc2bQ7TPM1 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prrc2bQ7TPM1 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Prrc2bQ7TPM1 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Prrc2bQ7TPM1 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Prrc2bQ7TPM1 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prrc2bQ7TPM1 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prrc2bQ7TPM1 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prrc2bQ7TPM1 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prrc2bQ7TPM1 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prrc2bQ7TPM1 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prrc2bQ7TPM1 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prrc2bQ7TPM1 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prrc2bQ7TPM1 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prrc2bQ7TPM1 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prrc2bQ7TPM1 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prrc2bQ7TPM1 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prrc2bQ7TPM1 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Prrc2bQ7TPM1 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Prrc2bQ7TPM1 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Prrc2bQ7TPM1 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Prrc2bQ7TPM1 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Prrc2bQ7TPM1 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Prrc2bQ7TPM1 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Prrc2bQ7TPM1 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Prrc2bQ7TPM1 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Prrc2bQ7TPM1 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Prrc2bQ7TPM1 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Prrc2bQ7TPM1 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Prrc2bQ7TPM1 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Prrc2bQ7TPM1 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Prrc2bQ7TPM1 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Prrc2bQ7TPM1 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Prrc2bQ7TPM1 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Prrc2bQ7TPM1 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Prrc2bQ7TPM1 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Prrc2bQ7TPM1 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prrc2bQ7TPM1 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prrc2bQ7TPM1 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prrc2bQ7TPM1 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prrc2bQ7TPM1 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prrc2bQ7TPM1 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prrc2bQ7TPM1 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prrc2bQ7TPM1 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prrc2bQ7TPM1 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prrc2bQ7TPM1 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prrc2bQ7TPM1 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prrc2bQ7TPM1 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prrc2bQ7TPM1 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prrc2bQ7TPM1 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Prrc2bQ7TPM1 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Prrc2bQ7TPM1 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prrc2bQ7TPM1 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prrc2bQ7TPM1 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prrc2bQ7TPM1 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Prrc2bQ7TPM1 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Prrc2bQ7TPM1 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prrc2bQ7TPM1 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prrc2bQ7TPM1 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prrc2bQ7TPM1 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prrc2bQ7TPM1 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prrc2bQ7TPM1 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prrc2bQ7TPM1 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prrc2bQ7TPM1 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prrc2bQ7TPM1 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prrc2bQ7TPM1 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prrc2bQ7TPM1 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prrc2bQ7TPM1 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Prrc2bQ7TPM1 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prrc2bQ7TPM1 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prrc2bQ7TPM1 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prrc2bQ7TPM1 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prrc2bQ7TPM1 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prrc2bQ7TPM1 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Prrc2bQ7TPM1 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prrc2bQ7TPM1 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Prrc2bQ7TPM1 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prrc2bQ7TPM1 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prrc2bQ7TPM1 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms