Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNK4

Zfp397, Zinc finger protein 397, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp397Q7TNK4 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zfp397Q7TNK4 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zfp397Q7TNK4 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zfp397Q7TNK4 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zfp397Q7TNK4 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zfp397Q7TNK4 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Zfp397Q7TNK4 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Zfp397Q7TNK4 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Zfp397Q7TNK4 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Zfp397Q7TNK4 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Zfp397Q7TNK4 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Zfp397Q7TNK4 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Zfp397Q7TNK4 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Zfp397Q7TNK4 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Zfp397Q7TNK4 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Zfp397Q7TNK4 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Zfp397Q7TNK4 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Zfp397Q7TNK4 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Zfp397Q7TNK4 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Zfp397Q7TNK4 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Zfp397Q7TNK4 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Zfp397Q7TNK4 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Zfp397Q7TNK4 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Zfp397Q7TNK4 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Zfp397Q7TNK4 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Zfp397Q7TNK4 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Zfp397Q7TNK4 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Zfp397Q7TNK4 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Zfp397Q7TNK4 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Zfp397Q7TNK4 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Zfp397Q7TNK4 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Zfp397Q7TNK4 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Zfp397Q7TNK4 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Zfp397Q7TNK4 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Zfp397Q7TNK4 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Zfp397Q7TNK4 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Zfp397Q7TNK4 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Zfp397Q7TNK4 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Zfp397Q7TNK4 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Zfp397Q7TNK4 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Zfp397Q7TNK4 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Zfp397Q7TNK4 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Zfp397Q7TNK4 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Zfp397Q7TNK4 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Zfp397Q7TNK4 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Zfp397Q7TNK4 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Zfp397Q7TNK4 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Zfp397Q7TNK4 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Zfp397Q7TNK4 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Zfp397Q7TNK4 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Zfp397Q7TNK4 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Zfp397Q7TNK4 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Zfp397Q7TNK4 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Zfp397Q7TNK4 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Zfp397Q7TNK4 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Zfp397Q7TNK4 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Zfp397Q7TNK4 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Zfp397Q7TNK4 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Zfp397Q7TNK4 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Zfp397Q7TNK4 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Zfp397Q7TNK4 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Zfp397Q7TNK4 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Zfp397Q7TNK4 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Zfp397Q7TNK4 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Zfp397Q7TNK4 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Zfp397Q7TNK4 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Zfp397Q7TNK4 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Zfp397Q7TNK4 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Zfp397Q7TNK4 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Zfp397Q7TNK4 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Zfp397Q7TNK4 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Zfp397Q7TNK4 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Zfp397Q7TNK4 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Zfp397Q7TNK4 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Zfp397Q7TNK4 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Zfp397Q7TNK4 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Zfp397Q7TNK4 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Zfp397Q7TNK4 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Zfp397Q7TNK4 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Zfp397Q7TNK4 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Zfp397Q7TNK4 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Zfp397Q7TNK4 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Zfp397Q7TNK4 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Zfp397Q7TNK4 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Zfp397Q7TNK4 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Zfp397Q7TNK4 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Zfp397Q7TNK4 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Zfp397Q7TNK4 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Zfp397Q7TNK4 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Zfp397Q7TNK4 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Zfp397Q7TNK4 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Zfp397Q7TNK4 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Zfp397Q7TNK4 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Zfp397Q7TNK4 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Zfp397Q7TNK4 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Zfp397Q7TNK4 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Zfp397Q7TNK4 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Zfp397Q7TNK4 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Zfp397Q7TNK4 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Zfp397Q7TNK4 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms