Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN58

Tmc8, Transmembrane channel-like protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmc8Q7TN58 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmc8Q7TN58 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmc8Q7TN58 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmc8Q7TN58 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmc8Q7TN58 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmc8Q7TN58 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmc8Q7TN58 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tmc8Q7TN58 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tmc8Q7TN58 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tmc8Q7TN58 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tmc8Q7TN58 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tmc8Q7TN58 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tmc8Q7TN58 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tmc8Q7TN58 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tmc8Q7TN58 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmc8Q7TN58 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmc8Q7TN58 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmc8Q7TN58 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmc8Q7TN58 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmc8Q7TN58 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmc8Q7TN58 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmc8Q7TN58 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmc8Q7TN58 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmc8Q7TN58 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmc8Q7TN58 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmc8Q7TN58 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmc8Q7TN58 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmc8Q7TN58 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmc8Q7TN58 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmc8Q7TN58 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmc8Q7TN58 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmc8Q7TN58 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmc8Q7TN58 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmc8Q7TN58 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmc8Q7TN58 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmc8Q7TN58 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmc8Q7TN58 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmc8Q7TN58 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tmc8Q7TN58 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmc8Q7TN58 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmc8Q7TN58 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmc8Q7TN58 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Tmc8Q7TN58 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Tmc8Q7TN58 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmc8Q7TN58 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmc8Q7TN58 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tmc8Q7TN58 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Tmc8Q7TN58 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmc8Q7TN58 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmc8Q7TN58 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmc8Q7TN58 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17■□□□□ 0.31
Tmc8Q7TN58 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmc8Q7TN58 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tmc8Q7TN58 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmc8Q7TN58 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Tmc8Q7TN58 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmc8Q7TN58 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmc8Q7TN58 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmc8Q7TN58 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmc8Q7TN58 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmc8Q7TN58 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmc8Q7TN58 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmc8Q7TN58 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmc8Q7TN58 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmc8Q7TN58 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmc8Q7TN58 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmc8Q7TN58 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmc8Q7TN58 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmc8Q7TN58 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmc8Q7TN58 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmc8Q7TN58 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmc8Q7TN58 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmc8Q7TN58 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmc8Q7TN58 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmc8Q7TN58 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmc8Q7TN58 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmc8Q7TN58 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmc8Q7TN58 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmc8Q7TN58 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmc8Q7TN58 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmc8Q7TN58 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmc8Q7TN58 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmc8Q7TN58 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmc8Q7TN58 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmc8Q7TN58 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmc8Q7TN58 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmc8Q7TN58 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmc8Q7TN58 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmc8Q7TN58 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmc8Q7TN58 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmc8Q7TN58 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmc8Q7TN58 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmc8Q7TN58 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmc8Q7TN58 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmc8Q7TN58 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmc8Q7TN58 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmc8Q7TN58 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmc8Q7TN58 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmc8Q7TN58 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmc8Q7TN58 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms