Protein–RNA interactions for Protein: Q7M6Y2

Sox11, Transcription factor SOX-11, mousemouse

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Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox11Q7M6Y2 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox11Q7M6Y2 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox11Q7M6Y2 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox11Q7M6Y2 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox11Q7M6Y2 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox11Q7M6Y2 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox11Q7M6Y2 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox11Q7M6Y2 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox11Q7M6Y2 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox11Q7M6Y2 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox11Q7M6Y2 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox11Q7M6Y2 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox11Q7M6Y2 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox11Q7M6Y2 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox11Q7M6Y2 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox11Q7M6Y2 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox11Q7M6Y2 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox11Q7M6Y2 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox11Q7M6Y2 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox11Q7M6Y2 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox11Q7M6Y2 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox11Q7M6Y2 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox11Q7M6Y2 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox11Q7M6Y2 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox11Q7M6Y2 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox11Q7M6Y2 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox11Q7M6Y2 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox11Q7M6Y2 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox11Q7M6Y2 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox11Q7M6Y2 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox11Q7M6Y2 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox11Q7M6Y2 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox11Q7M6Y2 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox11Q7M6Y2 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox11Q7M6Y2 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox11Q7M6Y2 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox11Q7M6Y2 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox11Q7M6Y2 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox11Q7M6Y2 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox11Q7M6Y2 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox11Q7M6Y2 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox11Q7M6Y2 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox11Q7M6Y2 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox11Q7M6Y2 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox11Q7M6Y2 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox11Q7M6Y2 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox11Q7M6Y2 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox11Q7M6Y2 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox11Q7M6Y2 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox11Q7M6Y2 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox11Q7M6Y2 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox11Q7M6Y2 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox11Q7M6Y2 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox11Q7M6Y2 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox11Q7M6Y2 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox11Q7M6Y2 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox11Q7M6Y2 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox11Q7M6Y2 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox11Q7M6Y2 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox11Q7M6Y2 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox11Q7M6Y2 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox11Q7M6Y2 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox11Q7M6Y2 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox11Q7M6Y2 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox11Q7M6Y2 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox11Q7M6Y2 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox11Q7M6Y2 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox11Q7M6Y2 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox11Q7M6Y2 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox11Q7M6Y2 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox11Q7M6Y2 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox11Q7M6Y2 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox11Q7M6Y2 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox11Q7M6Y2 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox11Q7M6Y2 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox11Q7M6Y2 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox11Q7M6Y2 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox11Q7M6Y2 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox11Q7M6Y2 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox11Q7M6Y2 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox11Q7M6Y2 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox11Q7M6Y2 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox11Q7M6Y2 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox11Q7M6Y2 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox11Q7M6Y2 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox11Q7M6Y2 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox11Q7M6Y2 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox11Q7M6Y2 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox11Q7M6Y2 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox11Q7M6Y2 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox11Q7M6Y2 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox11Q7M6Y2 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox11Q7M6Y2 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox11Q7M6Y2 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox11Q7M6Y2 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox11Q7M6Y2 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox11Q7M6Y2 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox11Q7M6Y2 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox11Q7M6Y2 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox11Q7M6Y2 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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