Protein–RNA interactions for Protein: Q78WZ7

Twistnb, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwistnbQ78WZ7 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TwistnbQ78WZ7 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TwistnbQ78WZ7 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TwistnbQ78WZ7 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TwistnbQ78WZ7 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TwistnbQ78WZ7 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TwistnbQ78WZ7 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TwistnbQ78WZ7 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TwistnbQ78WZ7 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TwistnbQ78WZ7 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TwistnbQ78WZ7 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TwistnbQ78WZ7 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TwistnbQ78WZ7 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TwistnbQ78WZ7 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TwistnbQ78WZ7 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TwistnbQ78WZ7 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TwistnbQ78WZ7 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TwistnbQ78WZ7 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TwistnbQ78WZ7 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TwistnbQ78WZ7 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TwistnbQ78WZ7 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TwistnbQ78WZ7 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TwistnbQ78WZ7 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TwistnbQ78WZ7 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TwistnbQ78WZ7 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TwistnbQ78WZ7 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TwistnbQ78WZ7 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TwistnbQ78WZ7 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TwistnbQ78WZ7 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TwistnbQ78WZ7 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TwistnbQ78WZ7 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TwistnbQ78WZ7 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TwistnbQ78WZ7 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TwistnbQ78WZ7 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TwistnbQ78WZ7 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TwistnbQ78WZ7 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TwistnbQ78WZ7 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TwistnbQ78WZ7 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TwistnbQ78WZ7 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TwistnbQ78WZ7 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TwistnbQ78WZ7 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TwistnbQ78WZ7 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TwistnbQ78WZ7 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TwistnbQ78WZ7 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TwistnbQ78WZ7 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TwistnbQ78WZ7 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TwistnbQ78WZ7 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TwistnbQ78WZ7 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TwistnbQ78WZ7 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TwistnbQ78WZ7 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TwistnbQ78WZ7 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TwistnbQ78WZ7 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TwistnbQ78WZ7 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TwistnbQ78WZ7 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TwistnbQ78WZ7 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TwistnbQ78WZ7 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TwistnbQ78WZ7 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TwistnbQ78WZ7 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TwistnbQ78WZ7 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TwistnbQ78WZ7 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TwistnbQ78WZ7 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TwistnbQ78WZ7 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TwistnbQ78WZ7 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TwistnbQ78WZ7 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TwistnbQ78WZ7 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TwistnbQ78WZ7 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TwistnbQ78WZ7 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TwistnbQ78WZ7 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TwistnbQ78WZ7 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TwistnbQ78WZ7 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TwistnbQ78WZ7 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TwistnbQ78WZ7 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TwistnbQ78WZ7 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TwistnbQ78WZ7 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TwistnbQ78WZ7 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TwistnbQ78WZ7 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TwistnbQ78WZ7 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TwistnbQ78WZ7 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TwistnbQ78WZ7 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TwistnbQ78WZ7 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TwistnbQ78WZ7 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TwistnbQ78WZ7 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TwistnbQ78WZ7 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TwistnbQ78WZ7 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TwistnbQ78WZ7 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TwistnbQ78WZ7 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TwistnbQ78WZ7 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TwistnbQ78WZ7 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TwistnbQ78WZ7 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TwistnbQ78WZ7 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TwistnbQ78WZ7 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TwistnbQ78WZ7 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TwistnbQ78WZ7 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TwistnbQ78WZ7 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TwistnbQ78WZ7 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TwistnbQ78WZ7 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TwistnbQ78WZ7 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TwistnbQ78WZ7 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TwistnbQ78WZ7 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TwistnbQ78WZ7 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms