Protein–RNA interactions for Protein: Q704Y3

Trpv1, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 1, mousemouse

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv1Q704Y3 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trpv1Q704Y3 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trpv1Q704Y3 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trpv1Q704Y3 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trpv1Q704Y3 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trpv1Q704Y3 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trpv1Q704Y3 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trpv1Q704Y3 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trpv1Q704Y3 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trpv1Q704Y3 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trpv1Q704Y3 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trpv1Q704Y3 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trpv1Q704Y3 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trpv1Q704Y3 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trpv1Q704Y3 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trpv1Q704Y3 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trpv1Q704Y3 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trpv1Q704Y3 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trpv1Q704Y3 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trpv1Q704Y3 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trpv1Q704Y3 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trpv1Q704Y3 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trpv1Q704Y3 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trpv1Q704Y3 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trpv1Q704Y3 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trpv1Q704Y3 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trpv1Q704Y3 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trpv1Q704Y3 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trpv1Q704Y3 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trpv1Q704Y3 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Trpv1Q704Y3 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trpv1Q704Y3 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trpv1Q704Y3 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trpv1Q704Y3 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Trpv1Q704Y3 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Trpv1Q704Y3 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trpv1Q704Y3 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Trpv1Q704Y3 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trpv1Q704Y3 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trpv1Q704Y3 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Trpv1Q704Y3 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Trpv1Q704Y3 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trpv1Q704Y3 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trpv1Q704Y3 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trpv1Q704Y3 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trpv1Q704Y3 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trpv1Q704Y3 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trpv1Q704Y3 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trpv1Q704Y3 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trpv1Q704Y3 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trpv1Q704Y3 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trpv1Q704Y3 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trpv1Q704Y3 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trpv1Q704Y3 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trpv1Q704Y3 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trpv1Q704Y3 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trpv1Q704Y3 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trpv1Q704Y3 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trpv1Q704Y3 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trpv1Q704Y3 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trpv1Q704Y3 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trpv1Q704Y3 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trpv1Q704Y3 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trpv1Q704Y3 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trpv1Q704Y3 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trpv1Q704Y3 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trpv1Q704Y3 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trpv1Q704Y3 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Trpv1Q704Y3 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trpv1Q704Y3 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trpv1Q704Y3 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trpv1Q704Y3 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trpv1Q704Y3 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trpv1Q704Y3 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trpv1Q704Y3 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trpv1Q704Y3 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trpv1Q704Y3 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trpv1Q704Y3 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trpv1Q704Y3 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Trpv1Q704Y3 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Trpv1Q704Y3 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trpv1Q704Y3 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trpv1Q704Y3 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trpv1Q704Y3 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trpv1Q704Y3 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Trpv1Q704Y3 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trpv1Q704Y3 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trpv1Q704Y3 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trpv1Q704Y3 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trpv1Q704Y3 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trpv1Q704Y3 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trpv1Q704Y3 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trpv1Q704Y3 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trpv1Q704Y3 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trpv1Q704Y3 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trpv1Q704Y3 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trpv1Q704Y3 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trpv1Q704Y3 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trpv1Q704Y3 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trpv1Q704Y3 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms