Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Topbp1Q6ZQF0 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Topbp1Q6ZQF0 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Topbp1Q6ZQF0 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Topbp1Q6ZQF0 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Topbp1Q6ZQF0 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Topbp1Q6ZQF0 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Topbp1Q6ZQF0 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Topbp1Q6ZQF0 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Topbp1Q6ZQF0 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Topbp1Q6ZQF0 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Topbp1Q6ZQF0 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Topbp1Q6ZQF0 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Topbp1Q6ZQF0 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Topbp1Q6ZQF0 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Topbp1Q6ZQF0 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Topbp1Q6ZQF0 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Topbp1Q6ZQF0 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Topbp1Q6ZQF0 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Topbp1Q6ZQF0 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Topbp1Q6ZQF0 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Topbp1Q6ZQF0 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Topbp1Q6ZQF0 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Topbp1Q6ZQF0 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Topbp1Q6ZQF0 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Topbp1Q6ZQF0 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Topbp1Q6ZQF0 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Topbp1Q6ZQF0 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Topbp1Q6ZQF0 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Topbp1Q6ZQF0 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Topbp1Q6ZQF0 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Topbp1Q6ZQF0 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Topbp1Q6ZQF0 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Topbp1Q6ZQF0 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Topbp1Q6ZQF0 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Topbp1Q6ZQF0 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Topbp1Q6ZQF0 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Topbp1Q6ZQF0 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Topbp1Q6ZQF0 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Topbp1Q6ZQF0 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Topbp1Q6ZQF0 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Topbp1Q6ZQF0 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Topbp1Q6ZQF0 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Topbp1Q6ZQF0 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Topbp1Q6ZQF0 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Topbp1Q6ZQF0 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Topbp1Q6ZQF0 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Topbp1Q6ZQF0 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Topbp1Q6ZQF0 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Topbp1Q6ZQF0 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Topbp1Q6ZQF0 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Topbp1Q6ZQF0 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Topbp1Q6ZQF0 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Topbp1Q6ZQF0 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Topbp1Q6ZQF0 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Topbp1Q6ZQF0 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Topbp1Q6ZQF0 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Topbp1Q6ZQF0 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Topbp1Q6ZQF0 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Topbp1Q6ZQF0 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Topbp1Q6ZQF0 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Topbp1Q6ZQF0 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Topbp1Q6ZQF0 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Topbp1Q6ZQF0 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Topbp1Q6ZQF0 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Topbp1Q6ZQF0 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Topbp1Q6ZQF0 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Topbp1Q6ZQF0 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Topbp1Q6ZQF0 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Topbp1Q6ZQF0 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Topbp1Q6ZQF0 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Topbp1Q6ZQF0 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Topbp1Q6ZQF0 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Topbp1Q6ZQF0 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Topbp1Q6ZQF0 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Topbp1Q6ZQF0 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Topbp1Q6ZQF0 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Topbp1Q6ZQF0 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Topbp1Q6ZQF0 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Topbp1Q6ZQF0 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Topbp1Q6ZQF0 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Topbp1Q6ZQF0 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Topbp1Q6ZQF0 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Topbp1Q6ZQF0 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Topbp1Q6ZQF0 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Topbp1Q6ZQF0 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Topbp1Q6ZQF0 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Topbp1Q6ZQF0 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Topbp1Q6ZQF0 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Topbp1Q6ZQF0 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Topbp1Q6ZQF0 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Topbp1Q6ZQF0 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Topbp1Q6ZQF0 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Topbp1Q6ZQF0 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Topbp1Q6ZQF0 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Topbp1Q6ZQF0 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Topbp1Q6ZQF0 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Topbp1Q6ZQF0 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Topbp1Q6ZQF0 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Topbp1Q6ZQF0 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.6 ms