Protein–RNA interactions for Protein: Q6W5C0

Cxcl3, C-X-C motif chemokine 3, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl3Q6W5C0 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cxcl3Q6W5C0 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cxcl3Q6W5C0 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cxcl3Q6W5C0 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cxcl3Q6W5C0 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cxcl3Q6W5C0 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cxcl3Q6W5C0 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cxcl3Q6W5C0 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cxcl3Q6W5C0 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cxcl3Q6W5C0 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cxcl3Q6W5C0 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cxcl3Q6W5C0 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cxcl3Q6W5C0 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cxcl3Q6W5C0 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cxcl3Q6W5C0 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cxcl3Q6W5C0 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cxcl3Q6W5C0 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cxcl3Q6W5C0 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cxcl3Q6W5C0 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cxcl3Q6W5C0 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cxcl3Q6W5C0 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cxcl3Q6W5C0 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cxcl3Q6W5C0 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cxcl3Q6W5C0 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cxcl3Q6W5C0 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cxcl3Q6W5C0 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cxcl3Q6W5C0 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cxcl3Q6W5C0 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cxcl3Q6W5C0 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cxcl3Q6W5C0 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cxcl3Q6W5C0 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cxcl3Q6W5C0 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cxcl3Q6W5C0 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cxcl3Q6W5C0 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cxcl3Q6W5C0 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cxcl3Q6W5C0 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcl3Q6W5C0 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcl3Q6W5C0 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcl3Q6W5C0 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcl3Q6W5C0 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcl3Q6W5C0 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcl3Q6W5C0 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcl3Q6W5C0 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcl3Q6W5C0 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcl3Q6W5C0 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcl3Q6W5C0 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcl3Q6W5C0 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcl3Q6W5C0 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcl3Q6W5C0 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcl3Q6W5C0 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcl3Q6W5C0 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcl3Q6W5C0 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcl3Q6W5C0 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcl3Q6W5C0 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcl3Q6W5C0 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcl3Q6W5C0 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcl3Q6W5C0 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcl3Q6W5C0 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcl3Q6W5C0 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcl3Q6W5C0 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcl3Q6W5C0 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcl3Q6W5C0 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcl3Q6W5C0 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcl3Q6W5C0 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcl3Q6W5C0 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcl3Q6W5C0 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcl3Q6W5C0 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcl3Q6W5C0 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcl3Q6W5C0 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcl3Q6W5C0 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcl3Q6W5C0 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcl3Q6W5C0 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcl3Q6W5C0 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcl3Q6W5C0 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcl3Q6W5C0 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcl3Q6W5C0 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcl3Q6W5C0 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cxcl3Q6W5C0 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcl3Q6W5C0 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcl3Q6W5C0 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcl3Q6W5C0 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcl3Q6W5C0 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcl3Q6W5C0 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcl3Q6W5C0 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcl3Q6W5C0 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcl3Q6W5C0 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcl3Q6W5C0 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcl3Q6W5C0 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcl3Q6W5C0 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcl3Q6W5C0 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcl3Q6W5C0 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcl3Q6W5C0 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcl3Q6W5C0 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcl3Q6W5C0 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcl3Q6W5C0 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcl3Q6W5C0 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcl3Q6W5C0 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcl3Q6W5C0 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcl3Q6W5C0 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcl3Q6W5C0 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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