Protein–RNA interactions for Protein: Q6SJQ0

Cd300a, CMRF35-like molecule 8, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300aQ6SJQ0 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd300aQ6SJQ0 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd300aQ6SJQ0 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd300aQ6SJQ0 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd300aQ6SJQ0 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd300aQ6SJQ0 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd300aQ6SJQ0 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd300aQ6SJQ0 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd300aQ6SJQ0 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd300aQ6SJQ0 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd300aQ6SJQ0 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd300aQ6SJQ0 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd300aQ6SJQ0 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd300aQ6SJQ0 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd300aQ6SJQ0 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd300aQ6SJQ0 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd300aQ6SJQ0 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd300aQ6SJQ0 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd300aQ6SJQ0 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd300aQ6SJQ0 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd300aQ6SJQ0 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd300aQ6SJQ0 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd300aQ6SJQ0 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd300aQ6SJQ0 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd300aQ6SJQ0 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd300aQ6SJQ0 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd300aQ6SJQ0 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd300aQ6SJQ0 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd300aQ6SJQ0 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd300aQ6SJQ0 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd300aQ6SJQ0 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd300aQ6SJQ0 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd300aQ6SJQ0 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd300aQ6SJQ0 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd300aQ6SJQ0 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd300aQ6SJQ0 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd300aQ6SJQ0 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd300aQ6SJQ0 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd300aQ6SJQ0 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd300aQ6SJQ0 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd300aQ6SJQ0 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd300aQ6SJQ0 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd300aQ6SJQ0 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd300aQ6SJQ0 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd300aQ6SJQ0 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd300aQ6SJQ0 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd300aQ6SJQ0 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd300aQ6SJQ0 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd300aQ6SJQ0 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd300aQ6SJQ0 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd300aQ6SJQ0 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd300aQ6SJQ0 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd300aQ6SJQ0 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd300aQ6SJQ0 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd300aQ6SJQ0 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd300aQ6SJQ0 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd300aQ6SJQ0 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd300aQ6SJQ0 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd300aQ6SJQ0 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd300aQ6SJQ0 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd300aQ6SJQ0 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd300aQ6SJQ0 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd300aQ6SJQ0 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd300aQ6SJQ0 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd300aQ6SJQ0 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd300aQ6SJQ0 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd300aQ6SJQ0 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd300aQ6SJQ0 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd300aQ6SJQ0 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd300aQ6SJQ0 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd300aQ6SJQ0 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd300aQ6SJQ0 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd300aQ6SJQ0 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd300aQ6SJQ0 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd300aQ6SJQ0 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd300aQ6SJQ0 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd300aQ6SJQ0 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd300aQ6SJQ0 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd300aQ6SJQ0 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd300aQ6SJQ0 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd300aQ6SJQ0 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd300aQ6SJQ0 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd300aQ6SJQ0 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd300aQ6SJQ0 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd300aQ6SJQ0 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd300aQ6SJQ0 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd300aQ6SJQ0 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd300aQ6SJQ0 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd300aQ6SJQ0 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd300aQ6SJQ0 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd300aQ6SJQ0 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd300aQ6SJQ0 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd300aQ6SJQ0 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd300aQ6SJQ0 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd300aQ6SJQ0 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd300aQ6SJQ0 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd300aQ6SJQ0 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd300aQ6SJQ0 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd300aQ6SJQ0 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd300aQ6SJQ0 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms