Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHS9

Cacna2d2, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d2Q6PHS9 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cacna2d2Q6PHS9 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cacna2d2Q6PHS9 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cacna2d2Q6PHS9 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cacna2d2Q6PHS9 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cacna2d2Q6PHS9 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cacna2d2Q6PHS9 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cacna2d2Q6PHS9 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cacna2d2Q6PHS9 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cacna2d2Q6PHS9 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cacna2d2Q6PHS9 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cacna2d2Q6PHS9 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cacna2d2Q6PHS9 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cacna2d2Q6PHS9 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cacna2d2Q6PHS9 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cacna2d2Q6PHS9 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cacna2d2Q6PHS9 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cacna2d2Q6PHS9 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cacna2d2Q6PHS9 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cacna2d2Q6PHS9 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cacna2d2Q6PHS9 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cacna2d2Q6PHS9 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cacna2d2Q6PHS9 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cacna2d2Q6PHS9 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cacna2d2Q6PHS9 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cacna2d2Q6PHS9 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cacna2d2Q6PHS9 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cacna2d2Q6PHS9 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cacna2d2Q6PHS9 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cacna2d2Q6PHS9 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cacna2d2Q6PHS9 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cacna2d2Q6PHS9 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cacna2d2Q6PHS9 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cacna2d2Q6PHS9 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cacna2d2Q6PHS9 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cacna2d2Q6PHS9 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cacna2d2Q6PHS9 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cacna2d2Q6PHS9 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cacna2d2Q6PHS9 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cacna2d2Q6PHS9 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cacna2d2Q6PHS9 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cacna2d2Q6PHS9 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cacna2d2Q6PHS9 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cacna2d2Q6PHS9 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cacna2d2Q6PHS9 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cacna2d2Q6PHS9 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cacna2d2Q6PHS9 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cacna2d2Q6PHS9 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cacna2d2Q6PHS9 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cacna2d2Q6PHS9 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cacna2d2Q6PHS9 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cacna2d2Q6PHS9 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cacna2d2Q6PHS9 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cacna2d2Q6PHS9 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cacna2d2Q6PHS9 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cacna2d2Q6PHS9 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cacna2d2Q6PHS9 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cacna2d2Q6PHS9 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cacna2d2Q6PHS9 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cacna2d2Q6PHS9 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cacna2d2Q6PHS9 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cacna2d2Q6PHS9 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacna2d2Q6PHS9 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacna2d2Q6PHS9 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacna2d2Q6PHS9 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacna2d2Q6PHS9 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacna2d2Q6PHS9 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacna2d2Q6PHS9 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacna2d2Q6PHS9 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacna2d2Q6PHS9 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacna2d2Q6PHS9 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacna2d2Q6PHS9 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacna2d2Q6PHS9 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacna2d2Q6PHS9 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacna2d2Q6PHS9 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacna2d2Q6PHS9 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacna2d2Q6PHS9 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacna2d2Q6PHS9 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacna2d2Q6PHS9 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacna2d2Q6PHS9 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacna2d2Q6PHS9 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacna2d2Q6PHS9 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacna2d2Q6PHS9 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacna2d2Q6PHS9 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacna2d2Q6PHS9 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacna2d2Q6PHS9 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cacna2d2Q6PHS9 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cacna2d2Q6PHS9 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cacna2d2Q6PHS9 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cacna2d2Q6PHS9 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cacna2d2Q6PHS9 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cacna2d2Q6PHS9 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cacna2d2Q6PHS9 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cacna2d2Q6PHS9 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cacna2d2Q6PHS9 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cacna2d2Q6PHS9 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cacna2d2Q6PHS9 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cacna2d2Q6PHS9 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cacna2d2Q6PHS9 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cacna2d2Q6PHS9 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 145.7 ms