Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE3

Rad54b, DNA repair and recombination protein RAD54B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54bQ6PFE3 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rad54bQ6PFE3 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rad54bQ6PFE3 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rad54bQ6PFE3 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rad54bQ6PFE3 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rad54bQ6PFE3 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rad54bQ6PFE3 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rad54bQ6PFE3 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rad54bQ6PFE3 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rad54bQ6PFE3 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rad54bQ6PFE3 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rad54bQ6PFE3 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rad54bQ6PFE3 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rad54bQ6PFE3 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rad54bQ6PFE3 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rad54bQ6PFE3 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rad54bQ6PFE3 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rad54bQ6PFE3 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rad54bQ6PFE3 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rad54bQ6PFE3 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rad54bQ6PFE3 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rad54bQ6PFE3 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rad54bQ6PFE3 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rad54bQ6PFE3 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rad54bQ6PFE3 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rad54bQ6PFE3 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rad54bQ6PFE3 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rad54bQ6PFE3 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rad54bQ6PFE3 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rad54bQ6PFE3 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rad54bQ6PFE3 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rad54bQ6PFE3 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rad54bQ6PFE3 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rad54bQ6PFE3 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rad54bQ6PFE3 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rad54bQ6PFE3 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rad54bQ6PFE3 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rad54bQ6PFE3 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rad54bQ6PFE3 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rad54bQ6PFE3 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rad54bQ6PFE3 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rad54bQ6PFE3 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rad54bQ6PFE3 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rad54bQ6PFE3 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rad54bQ6PFE3 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rad54bQ6PFE3 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rad54bQ6PFE3 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rad54bQ6PFE3 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rad54bQ6PFE3 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rad54bQ6PFE3 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rad54bQ6PFE3 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rad54bQ6PFE3 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rad54bQ6PFE3 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rad54bQ6PFE3 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rad54bQ6PFE3 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rad54bQ6PFE3 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rad54bQ6PFE3 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rad54bQ6PFE3 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rad54bQ6PFE3 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rad54bQ6PFE3 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rad54bQ6PFE3 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rad54bQ6PFE3 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rad54bQ6PFE3 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rad54bQ6PFE3 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rad54bQ6PFE3 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rad54bQ6PFE3 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rad54bQ6PFE3 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rad54bQ6PFE3 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rad54bQ6PFE3 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rad54bQ6PFE3 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rad54bQ6PFE3 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rad54bQ6PFE3 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rad54bQ6PFE3 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rad54bQ6PFE3 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rad54bQ6PFE3 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rad54bQ6PFE3 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rad54bQ6PFE3 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rad54bQ6PFE3 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rad54bQ6PFE3 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rad54bQ6PFE3 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rad54bQ6PFE3 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rad54bQ6PFE3 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rad54bQ6PFE3 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rad54bQ6PFE3 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rad54bQ6PFE3 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rad54bQ6PFE3 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rad54bQ6PFE3 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rad54bQ6PFE3 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rad54bQ6PFE3 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rad54bQ6PFE3 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rad54bQ6PFE3 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rad54bQ6PFE3 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rad54bQ6PFE3 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rad54bQ6PFE3 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rad54bQ6PFE3 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rad54bQ6PFE3 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rad54bQ6PFE3 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rad54bQ6PFE3 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rad54bQ6PFE3 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rad54bQ6PFE3 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms