Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE55

Pdgfrl, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrlQ6PE55 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PdgfrlQ6PE55 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PdgfrlQ6PE55 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PdgfrlQ6PE55 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PdgfrlQ6PE55 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PdgfrlQ6PE55 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PdgfrlQ6PE55 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PdgfrlQ6PE55 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PdgfrlQ6PE55 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PdgfrlQ6PE55 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PdgfrlQ6PE55 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PdgfrlQ6PE55 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PdgfrlQ6PE55 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PdgfrlQ6PE55 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PdgfrlQ6PE55 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PdgfrlQ6PE55 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PdgfrlQ6PE55 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PdgfrlQ6PE55 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PdgfrlQ6PE55 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PdgfrlQ6PE55 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PdgfrlQ6PE55 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PdgfrlQ6PE55 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PdgfrlQ6PE55 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PdgfrlQ6PE55 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PdgfrlQ6PE55 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PdgfrlQ6PE55 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PdgfrlQ6PE55 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PdgfrlQ6PE55 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PdgfrlQ6PE55 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PdgfrlQ6PE55 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PdgfrlQ6PE55 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PdgfrlQ6PE55 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PdgfrlQ6PE55 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PdgfrlQ6PE55 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PdgfrlQ6PE55 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PdgfrlQ6PE55 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PdgfrlQ6PE55 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PdgfrlQ6PE55 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PdgfrlQ6PE55 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PdgfrlQ6PE55 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PdgfrlQ6PE55 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PdgfrlQ6PE55 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PdgfrlQ6PE55 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PdgfrlQ6PE55 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PdgfrlQ6PE55 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PdgfrlQ6PE55 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PdgfrlQ6PE55 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PdgfrlQ6PE55 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PdgfrlQ6PE55 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PdgfrlQ6PE55 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PdgfrlQ6PE55 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PdgfrlQ6PE55 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PdgfrlQ6PE55 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PdgfrlQ6PE55 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PdgfrlQ6PE55 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PdgfrlQ6PE55 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PdgfrlQ6PE55 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PdgfrlQ6PE55 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PdgfrlQ6PE55 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PdgfrlQ6PE55 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PdgfrlQ6PE55 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PdgfrlQ6PE55 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PdgfrlQ6PE55 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PdgfrlQ6PE55 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PdgfrlQ6PE55 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PdgfrlQ6PE55 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PdgfrlQ6PE55 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PdgfrlQ6PE55 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PdgfrlQ6PE55 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PdgfrlQ6PE55 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PdgfrlQ6PE55 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PdgfrlQ6PE55 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PdgfrlQ6PE55 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PdgfrlQ6PE55 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PdgfrlQ6PE55 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PdgfrlQ6PE55 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PdgfrlQ6PE55 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PdgfrlQ6PE55 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PdgfrlQ6PE55 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PdgfrlQ6PE55 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PdgfrlQ6PE55 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PdgfrlQ6PE55 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PdgfrlQ6PE55 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PdgfrlQ6PE55 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PdgfrlQ6PE55 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PdgfrlQ6PE55 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PdgfrlQ6PE55 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PdgfrlQ6PE55 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PdgfrlQ6PE55 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PdgfrlQ6PE55 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PdgfrlQ6PE55 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PdgfrlQ6PE55 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PdgfrlQ6PE55 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PdgfrlQ6PE55 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PdgfrlQ6PE55 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PdgfrlQ6PE55 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PdgfrlQ6PE55 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PdgfrlQ6PE55 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PdgfrlQ6PE55 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PdgfrlQ6PE55 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.1 ms