Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8N9

Cyp2d40, Cytochrome P450, family 2, subfamily d, polypeptide 40, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2d40Q6P8N9 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cyp2d40Q6P8N9 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cyp2d40Q6P8N9 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cyp2d40Q6P8N9 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cyp2d40Q6P8N9 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cyp2d40Q6P8N9 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cyp2d40Q6P8N9 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cyp2d40Q6P8N9 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cyp2d40Q6P8N9 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cyp2d40Q6P8N9 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cyp2d40Q6P8N9 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cyp2d40Q6P8N9 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cyp2d40Q6P8N9 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cyp2d40Q6P8N9 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cyp2d40Q6P8N9 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cyp2d40Q6P8N9 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cyp2d40Q6P8N9 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cyp2d40Q6P8N9 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cyp2d40Q6P8N9 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cyp2d40Q6P8N9 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cyp2d40Q6P8N9 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cyp2d40Q6P8N9 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cyp2d40Q6P8N9 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cyp2d40Q6P8N9 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cyp2d40Q6P8N9 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms