Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5B0

Rrp12, RRP12-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp12Q6P5B0 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rrp12Q6P5B0 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rrp12Q6P5B0 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rrp12Q6P5B0 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rrp12Q6P5B0 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rrp12Q6P5B0 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rrp12Q6P5B0 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rrp12Q6P5B0 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Rrp12Q6P5B0 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rrp12Q6P5B0 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rrp12Q6P5B0 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rrp12Q6P5B0 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rrp12Q6P5B0 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rrp12Q6P5B0 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rrp12Q6P5B0 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rrp12Q6P5B0 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rrp12Q6P5B0 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rrp12Q6P5B0 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rrp12Q6P5B0 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rrp12Q6P5B0 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rrp12Q6P5B0 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rrp12Q6P5B0 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rrp12Q6P5B0 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rrp12Q6P5B0 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rrp12Q6P5B0 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rrp12Q6P5B0 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rrp12Q6P5B0 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rrp12Q6P5B0 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rrp12Q6P5B0 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rrp12Q6P5B0 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rrp12Q6P5B0 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rrp12Q6P5B0 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rrp12Q6P5B0 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rrp12Q6P5B0 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rrp12Q6P5B0 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rrp12Q6P5B0 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rrp12Q6P5B0 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rrp12Q6P5B0 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rrp12Q6P5B0 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rrp12Q6P5B0 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rrp12Q6P5B0 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rrp12Q6P5B0 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rrp12Q6P5B0 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rrp12Q6P5B0 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rrp12Q6P5B0 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rrp12Q6P5B0 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rrp12Q6P5B0 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rrp12Q6P5B0 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Rrp12Q6P5B0 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rrp12Q6P5B0 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rrp12Q6P5B0 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rrp12Q6P5B0 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rrp12Q6P5B0 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Rrp12Q6P5B0 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Rrp12Q6P5B0 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Rrp12Q6P5B0 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rrp12Q6P5B0 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Rrp12Q6P5B0 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rrp12Q6P5B0 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rrp12Q6P5B0 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rrp12Q6P5B0 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rrp12Q6P5B0 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rrp12Q6P5B0 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rrp12Q6P5B0 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Rrp12Q6P5B0 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rrp12Q6P5B0 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rrp12Q6P5B0 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rrp12Q6P5B0 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rrp12Q6P5B0 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rrp12Q6P5B0 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rrp12Q6P5B0 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rrp12Q6P5B0 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rrp12Q6P5B0 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rrp12Q6P5B0 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rrp12Q6P5B0 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rrp12Q6P5B0 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rrp12Q6P5B0 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rrp12Q6P5B0 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rrp12Q6P5B0 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rrp12Q6P5B0 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Rrp12Q6P5B0 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rrp12Q6P5B0 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rrp12Q6P5B0 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rrp12Q6P5B0 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rrp12Q6P5B0 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rrp12Q6P5B0 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rrp12Q6P5B0 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rrp12Q6P5B0 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rrp12Q6P5B0 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rrp12Q6P5B0 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rrp12Q6P5B0 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rrp12Q6P5B0 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rrp12Q6P5B0 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rrp12Q6P5B0 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rrp12Q6P5B0 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rrp12Q6P5B0 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rrp12Q6P5B0 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rrp12Q6P5B0 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Rrp12Q6P5B0 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rrp12Q6P5B0 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms