Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXI6

Rprd2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd2Q6NXI6 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rprd2Q6NXI6 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rprd2Q6NXI6 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rprd2Q6NXI6 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rprd2Q6NXI6 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rprd2Q6NXI6 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rprd2Q6NXI6 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rprd2Q6NXI6 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rprd2Q6NXI6 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rprd2Q6NXI6 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rprd2Q6NXI6 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rprd2Q6NXI6 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rprd2Q6NXI6 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rprd2Q6NXI6 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Rprd2Q6NXI6 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Rprd2Q6NXI6 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rprd2Q6NXI6 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rprd2Q6NXI6 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rprd2Q6NXI6 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rprd2Q6NXI6 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rprd2Q6NXI6 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rprd2Q6NXI6 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rprd2Q6NXI6 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rprd2Q6NXI6 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rprd2Q6NXI6 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rprd2Q6NXI6 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rprd2Q6NXI6 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rprd2Q6NXI6 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rprd2Q6NXI6 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rprd2Q6NXI6 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rprd2Q6NXI6 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Rprd2Q6NXI6 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rprd2Q6NXI6 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rprd2Q6NXI6 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rprd2Q6NXI6 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rprd2Q6NXI6 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rprd2Q6NXI6 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rprd2Q6NXI6 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rprd2Q6NXI6 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rprd2Q6NXI6 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rprd2Q6NXI6 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Rprd2Q6NXI6 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rprd2Q6NXI6 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rprd2Q6NXI6 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rprd2Q6NXI6 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rprd2Q6NXI6 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rprd2Q6NXI6 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rprd2Q6NXI6 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rprd2Q6NXI6 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rprd2Q6NXI6 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rprd2Q6NXI6 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rprd2Q6NXI6 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rprd2Q6NXI6 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rprd2Q6NXI6 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Rprd2Q6NXI6 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rprd2Q6NXI6 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rprd2Q6NXI6 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rprd2Q6NXI6 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rprd2Q6NXI6 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rprd2Q6NXI6 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rprd2Q6NXI6 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rprd2Q6NXI6 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rprd2Q6NXI6 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rprd2Q6NXI6 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rprd2Q6NXI6 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Rprd2Q6NXI6 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rprd2Q6NXI6 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rprd2Q6NXI6 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rprd2Q6NXI6 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Rprd2Q6NXI6 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rprd2Q6NXI6 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rprd2Q6NXI6 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rprd2Q6NXI6 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Rprd2Q6NXI6 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rprd2Q6NXI6 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rprd2Q6NXI6 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rprd2Q6NXI6 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rprd2Q6NXI6 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rprd2Q6NXI6 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rprd2Q6NXI6 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rprd2Q6NXI6 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rprd2Q6NXI6 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Rprd2Q6NXI6 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rprd2Q6NXI6 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rprd2Q6NXI6 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rprd2Q6NXI6 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rprd2Q6NXI6 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rprd2Q6NXI6 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rprd2Q6NXI6 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rprd2Q6NXI6 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rprd2Q6NXI6 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rprd2Q6NXI6 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rprd2Q6NXI6 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Rprd2Q6NXI6 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Rprd2Q6NXI6 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rprd2Q6NXI6 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rprd2Q6NXI6 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rprd2Q6NXI6 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rprd2Q6NXI6 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rprd2Q6NXI6 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms