Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXH3

Gpbp1, Vasculin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1Q6NXH3 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gpbp1Q6NXH3 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gpbp1Q6NXH3 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Gpbp1Q6NXH3 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Gpbp1Q6NXH3 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Gpbp1Q6NXH3 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gpbp1Q6NXH3 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gpbp1Q6NXH3 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gpbp1Q6NXH3 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gpbp1Q6NXH3 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gpbp1Q6NXH3 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gpbp1Q6NXH3 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gpbp1Q6NXH3 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gpbp1Q6NXH3 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gpbp1Q6NXH3 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gpbp1Q6NXH3 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gpbp1Q6NXH3 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gpbp1Q6NXH3 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gpbp1Q6NXH3 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gpbp1Q6NXH3 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gpbp1Q6NXH3 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gpbp1Q6NXH3 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gpbp1Q6NXH3 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gpbp1Q6NXH3 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gpbp1Q6NXH3 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gpbp1Q6NXH3 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gpbp1Q6NXH3 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gpbp1Q6NXH3 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gpbp1Q6NXH3 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Gpbp1Q6NXH3 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gpbp1Q6NXH3 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gpbp1Q6NXH3 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gpbp1Q6NXH3 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gpbp1Q6NXH3 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gpbp1Q6NXH3 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gpbp1Q6NXH3 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gpbp1Q6NXH3 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gpbp1Q6NXH3 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gpbp1Q6NXH3 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gpbp1Q6NXH3 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gpbp1Q6NXH3 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gpbp1Q6NXH3 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gpbp1Q6NXH3 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gpbp1Q6NXH3 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gpbp1Q6NXH3 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gpbp1Q6NXH3 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gpbp1Q6NXH3 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gpbp1Q6NXH3 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gpbp1Q6NXH3 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gpbp1Q6NXH3 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gpbp1Q6NXH3 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gpbp1Q6NXH3 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Gpbp1Q6NXH3 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gpbp1Q6NXH3 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Gpbp1Q6NXH3 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gpbp1Q6NXH3 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gpbp1Q6NXH3 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gpbp1Q6NXH3 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gpbp1Q6NXH3 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gpbp1Q6NXH3 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gpbp1Q6NXH3 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gpbp1Q6NXH3 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gpbp1Q6NXH3 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gpbp1Q6NXH3 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gpbp1Q6NXH3 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gpbp1Q6NXH3 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gpbp1Q6NXH3 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gpbp1Q6NXH3 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gpbp1Q6NXH3 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gpbp1Q6NXH3 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gpbp1Q6NXH3 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Gpbp1Q6NXH3 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gpbp1Q6NXH3 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gpbp1Q6NXH3 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gpbp1Q6NXH3 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gpbp1Q6NXH3 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gpbp1Q6NXH3 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gpbp1Q6NXH3 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gpbp1Q6NXH3 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gpbp1Q6NXH3 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gpbp1Q6NXH3 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gpbp1Q6NXH3 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Gpbp1Q6NXH3 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gpbp1Q6NXH3 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gpbp1Q6NXH3 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gpbp1Q6NXH3 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gpbp1Q6NXH3 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gpbp1Q6NXH3 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gpbp1Q6NXH3 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gpbp1Q6NXH3 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gpbp1Q6NXH3 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gpbp1Q6NXH3 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gpbp1Q6NXH3 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gpbp1Q6NXH3 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gpbp1Q6NXH3 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gpbp1Q6NXH3 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gpbp1Q6NXH3 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gpbp1Q6NXH3 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gpbp1Q6NXH3 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Gpbp1Q6NXH3 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms