Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF4

Helb, DNA helicase B, mousemouse

Predictions only

Length 1,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HelbQ6NVF4 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HelbQ6NVF4 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HelbQ6NVF4 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HelbQ6NVF4 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HelbQ6NVF4 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HelbQ6NVF4 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HelbQ6NVF4 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HelbQ6NVF4 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HelbQ6NVF4 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HelbQ6NVF4 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HelbQ6NVF4 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HelbQ6NVF4 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HelbQ6NVF4 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HelbQ6NVF4 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HelbQ6NVF4 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HelbQ6NVF4 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HelbQ6NVF4 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HelbQ6NVF4 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HelbQ6NVF4 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HelbQ6NVF4 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HelbQ6NVF4 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HelbQ6NVF4 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HelbQ6NVF4 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HelbQ6NVF4 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HelbQ6NVF4 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HelbQ6NVF4 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HelbQ6NVF4 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HelbQ6NVF4 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HelbQ6NVF4 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HelbQ6NVF4 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HelbQ6NVF4 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HelbQ6NVF4 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HelbQ6NVF4 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HelbQ6NVF4 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HelbQ6NVF4 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HelbQ6NVF4 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HelbQ6NVF4 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HelbQ6NVF4 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HelbQ6NVF4 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HelbQ6NVF4 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HelbQ6NVF4 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HelbQ6NVF4 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HelbQ6NVF4 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HelbQ6NVF4 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HelbQ6NVF4 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HelbQ6NVF4 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HelbQ6NVF4 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HelbQ6NVF4 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HelbQ6NVF4 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HelbQ6NVF4 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HelbQ6NVF4 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HelbQ6NVF4 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HelbQ6NVF4 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HelbQ6NVF4 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HelbQ6NVF4 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HelbQ6NVF4 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HelbQ6NVF4 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HelbQ6NVF4 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HelbQ6NVF4 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HelbQ6NVF4 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HelbQ6NVF4 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HelbQ6NVF4 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HelbQ6NVF4 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HelbQ6NVF4 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HelbQ6NVF4 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HelbQ6NVF4 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HelbQ6NVF4 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HelbQ6NVF4 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HelbQ6NVF4 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HelbQ6NVF4 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HelbQ6NVF4 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HelbQ6NVF4 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HelbQ6NVF4 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HelbQ6NVF4 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HelbQ6NVF4 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HelbQ6NVF4 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HelbQ6NVF4 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HelbQ6NVF4 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HelbQ6NVF4 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HelbQ6NVF4 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HelbQ6NVF4 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HelbQ6NVF4 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HelbQ6NVF4 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HelbQ6NVF4 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HelbQ6NVF4 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HelbQ6NVF4 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HelbQ6NVF4 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HelbQ6NVF4 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HelbQ6NVF4 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HelbQ6NVF4 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HelbQ6NVF4 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HelbQ6NVF4 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HelbQ6NVF4 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HelbQ6NVF4 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
HelbQ6NVF4 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HelbQ6NVF4 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HelbQ6NVF4 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HelbQ6NVF4 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HelbQ6NVF4 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HelbQ6NVF4 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms