Protein–RNA interactions for Protein: Q6IUP1

Sohlh1, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 1, mousemouse

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Length 357 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sohlh1Q6IUP1 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sohlh1Q6IUP1 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sohlh1Q6IUP1 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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