Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt40Q6IFX3 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt40Q6IFX3 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt40Q6IFX3 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt40Q6IFX3 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt40Q6IFX3 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt40Q6IFX3 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt40Q6IFX3 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt40Q6IFX3 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt40Q6IFX3 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt40Q6IFX3 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt40Q6IFX3 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt40Q6IFX3 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt40Q6IFX3 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt40Q6IFX3 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt40Q6IFX3 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt40Q6IFX3 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt40Q6IFX3 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt40Q6IFX3 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt40Q6IFX3 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt40Q6IFX3 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt40Q6IFX3 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt40Q6IFX3 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt40Q6IFX3 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt40Q6IFX3 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt40Q6IFX3 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt40Q6IFX3 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt40Q6IFX3 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt40Q6IFX3 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt40Q6IFX3 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt40Q6IFX3 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt40Q6IFX3 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt40Q6IFX3 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt40Q6IFX3 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt40Q6IFX3 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt40Q6IFX3 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt40Q6IFX3 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt40Q6IFX3 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Krt40Q6IFX3 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Krt40Q6IFX3 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Krt40Q6IFX3 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Krt40Q6IFX3 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Krt40Q6IFX3 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt40Q6IFX3 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt40Q6IFX3 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt40Q6IFX3 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt40Q6IFX3 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt40Q6IFX3 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt40Q6IFX3 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt40Q6IFX3 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt40Q6IFX3 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt40Q6IFX3 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt40Q6IFX3 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt40Q6IFX3 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt40Q6IFX3 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt40Q6IFX3 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt40Q6IFX3 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt40Q6IFX3 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt40Q6IFX3 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt40Q6IFX3 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt40Q6IFX3 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt40Q6IFX3 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt40Q6IFX3 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt40Q6IFX3 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt40Q6IFX3 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt40Q6IFX3 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt40Q6IFX3 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt40Q6IFX3 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt40Q6IFX3 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt40Q6IFX3 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt40Q6IFX3 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt40Q6IFX3 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt40Q6IFX3 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt40Q6IFX3 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt40Q6IFX3 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt40Q6IFX3 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt40Q6IFX3 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt40Q6IFX3 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt40Q6IFX3 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt40Q6IFX3 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt40Q6IFX3 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt40Q6IFX3 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt40Q6IFX3 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt40Q6IFX3 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt40Q6IFX3 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt40Q6IFX3 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt40Q6IFX3 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt40Q6IFX3 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt40Q6IFX3 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt40Q6IFX3 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt40Q6IFX3 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt40Q6IFX3 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt40Q6IFX3 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt40Q6IFX3 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt40Q6IFX3 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt40Q6IFX3 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt40Q6IFX3 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt40Q6IFX3 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt40Q6IFX3 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt40Q6IFX3 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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