Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFT4

Arhgap20, Rho GTPase-activating protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap20Q6IFT4 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arhgap20Q6IFT4 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms