Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZZ6

Tmcc1, Transmembrane and coiled-coil domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmcc1Q69ZZ6 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Tmcc1Q69ZZ6 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Tmcc1Q69ZZ6 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmcc1Q69ZZ6 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms