Protein–RNA interactions for Protein: Q69Z98

Brsk2, Serine/threonine-protein kinase BRSK2, mousemouse

Predictions only

Length 735 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brsk2Q69Z98 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brsk2Q69Z98 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brsk2Q69Z98 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brsk2Q69Z98 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brsk2Q69Z98 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brsk2Q69Z98 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brsk2Q69Z98 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brsk2Q69Z98 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brsk2Q69Z98 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brsk2Q69Z98 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brsk2Q69Z98 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brsk2Q69Z98 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brsk2Q69Z98 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brsk2Q69Z98 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brsk2Q69Z98 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brsk2Q69Z98 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brsk2Q69Z98 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brsk2Q69Z98 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brsk2Q69Z98 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brsk2Q69Z98 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brsk2Q69Z98 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Brsk2Q69Z98 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brsk2Q69Z98 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brsk2Q69Z98 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brsk2Q69Z98 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brsk2Q69Z98 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brsk2Q69Z98 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brsk2Q69Z98 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brsk2Q69Z98 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brsk2Q69Z98 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brsk2Q69Z98 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brsk2Q69Z98 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brsk2Q69Z98 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brsk2Q69Z98 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brsk2Q69Z98 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brsk2Q69Z98 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Brsk2Q69Z98 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Brsk2Q69Z98 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Brsk2Q69Z98 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brsk2Q69Z98 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brsk2Q69Z98 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brsk2Q69Z98 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brsk2Q69Z98 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Brsk2Q69Z98 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brsk2Q69Z98 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brsk2Q69Z98 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brsk2Q69Z98 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brsk2Q69Z98 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brsk2Q69Z98 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brsk2Q69Z98 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brsk2Q69Z98 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brsk2Q69Z98 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Brsk2Q69Z98 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Brsk2Q69Z98 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brsk2Q69Z98 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brsk2Q69Z98 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brsk2Q69Z98 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brsk2Q69Z98 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brsk2Q69Z98 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brsk2Q69Z98 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brsk2Q69Z98 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brsk2Q69Z98 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brsk2Q69Z98 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brsk2Q69Z98 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Brsk2Q69Z98 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Brsk2Q69Z98 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brsk2Q69Z98 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brsk2Q69Z98 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brsk2Q69Z98 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brsk2Q69Z98 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brsk2Q69Z98 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brsk2Q69Z98 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brsk2Q69Z98 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brsk2Q69Z98 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brsk2Q69Z98 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brsk2Q69Z98 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brsk2Q69Z98 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brsk2Q69Z98 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brsk2Q69Z98 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brsk2Q69Z98 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brsk2Q69Z98 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brsk2Q69Z98 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brsk2Q69Z98 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brsk2Q69Z98 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brsk2Q69Z98 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brsk2Q69Z98 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brsk2Q69Z98 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brsk2Q69Z98 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brsk2Q69Z98 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brsk2Q69Z98 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brsk2Q69Z98 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brsk2Q69Z98 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Brsk2Q69Z98 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brsk2Q69Z98 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brsk2Q69Z98 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brsk2Q69Z98 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brsk2Q69Z98 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brsk2Q69Z98 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brsk2Q69Z98 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Brsk2Q69Z98 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms