Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD9

Kiaa1549, UPF0606 protein KIAA1549, mousemouse

Predictions only

Length 1,940 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kiaa1549Q68FD9 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Kiaa1549Q68FD9 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Kiaa1549Q68FD9 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Kiaa1549Q68FD9 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Kiaa1549Q68FD9 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Kiaa1549Q68FD9 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Kiaa1549Q68FD9 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Kiaa1549Q68FD9 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Kiaa1549Q68FD9 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Kiaa1549Q68FD9 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Kiaa1549Q68FD9 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Kiaa1549Q68FD9 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Kiaa1549Q68FD9 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Kiaa1549Q68FD9 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Kiaa1549Q68FD9 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Kiaa1549Q68FD9 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Kiaa1549Q68FD9 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Kiaa1549Q68FD9 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Kiaa1549Q68FD9 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Kiaa1549Q68FD9 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Kiaa1549Q68FD9 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Kiaa1549Q68FD9 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Kiaa1549Q68FD9 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Kiaa1549Q68FD9 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Kiaa1549Q68FD9 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Kiaa1549Q68FD9 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Kiaa1549Q68FD9 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Kiaa1549Q68FD9 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Kiaa1549Q68FD9 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Kiaa1549Q68FD9 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Kiaa1549Q68FD9 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Kiaa1549Q68FD9 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Kiaa1549Q68FD9 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Kiaa1549Q68FD9 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Kiaa1549Q68FD9 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Kiaa1549Q68FD9 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Kiaa1549Q68FD9 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Kiaa1549Q68FD9 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Kiaa1549Q68FD9 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Kiaa1549Q68FD9 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Kiaa1549Q68FD9 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Kiaa1549Q68FD9 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Kiaa1549Q68FD9 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Kiaa1549Q68FD9 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Kiaa1549Q68FD9 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Kiaa1549Q68FD9 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Kiaa1549Q68FD9 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Kiaa1549Q68FD9 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Kiaa1549Q68FD9 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Kiaa1549Q68FD9 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Kiaa1549Q68FD9 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Kiaa1549Q68FD9 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Kiaa1549Q68FD9 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Kiaa1549Q68FD9 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Kiaa1549Q68FD9 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Kiaa1549Q68FD9 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Kiaa1549Q68FD9 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Kiaa1549Q68FD9 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Kiaa1549Q68FD9 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Kiaa1549Q68FD9 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Kiaa1549Q68FD9 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Kiaa1549Q68FD9 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Kiaa1549Q68FD9 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Kiaa1549Q68FD9 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Kiaa1549Q68FD9 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Kiaa1549Q68FD9 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Kiaa1549Q68FD9 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Kiaa1549Q68FD9 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Kiaa1549Q68FD9 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Kiaa1549Q68FD9 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Kiaa1549Q68FD9 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Kiaa1549Q68FD9 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Kiaa1549Q68FD9 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Kiaa1549Q68FD9 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Kiaa1549Q68FD9 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Kiaa1549Q68FD9 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Kiaa1549Q68FD9 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Kiaa1549Q68FD9 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Kiaa1549Q68FD9 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Kiaa1549Q68FD9 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Kiaa1549Q68FD9 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Kiaa1549Q68FD9 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Kiaa1549Q68FD9 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Kiaa1549Q68FD9 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Kiaa1549Q68FD9 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Kiaa1549Q68FD9 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Kiaa1549Q68FD9 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Kiaa1549Q68FD9 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Kiaa1549Q68FD9 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Kiaa1549Q68FD9 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Kiaa1549Q68FD9 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Kiaa1549Q68FD9 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Kiaa1549Q68FD9 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Kiaa1549Q68FD9 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Kiaa1549Q68FD9 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Kiaa1549Q68FD9 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Kiaa1549Q68FD9 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Kiaa1549Q68FD9 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Kiaa1549Q68FD9 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Kiaa1549Q68FD9 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms