Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD5

Cltc, Clathrin heavy chain 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltcQ68FD5 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CltcQ68FD5 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CltcQ68FD5 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CltcQ68FD5 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CltcQ68FD5 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CltcQ68FD5 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CltcQ68FD5 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CltcQ68FD5 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CltcQ68FD5 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CltcQ68FD5 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CltcQ68FD5 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CltcQ68FD5 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CltcQ68FD5 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CltcQ68FD5 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CltcQ68FD5 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CltcQ68FD5 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CltcQ68FD5 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CltcQ68FD5 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CltcQ68FD5 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CltcQ68FD5 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CltcQ68FD5 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CltcQ68FD5 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CltcQ68FD5 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CltcQ68FD5 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CltcQ68FD5 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CltcQ68FD5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CltcQ68FD5 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CltcQ68FD5 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CltcQ68FD5 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CltcQ68FD5 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CltcQ68FD5 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CltcQ68FD5 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CltcQ68FD5 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CltcQ68FD5 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CltcQ68FD5 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CltcQ68FD5 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CltcQ68FD5 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CltcQ68FD5 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CltcQ68FD5 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CltcQ68FD5 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CltcQ68FD5 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CltcQ68FD5 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CltcQ68FD5 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CltcQ68FD5 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CltcQ68FD5 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CltcQ68FD5 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CltcQ68FD5 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CltcQ68FD5 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CltcQ68FD5 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CltcQ68FD5 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CltcQ68FD5 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CltcQ68FD5 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CltcQ68FD5 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CltcQ68FD5 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CltcQ68FD5 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CltcQ68FD5 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CltcQ68FD5 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CltcQ68FD5 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CltcQ68FD5 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CltcQ68FD5 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CltcQ68FD5 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CltcQ68FD5 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CltcQ68FD5 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CltcQ68FD5 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CltcQ68FD5 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CltcQ68FD5 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CltcQ68FD5 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CltcQ68FD5 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CltcQ68FD5 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CltcQ68FD5 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CltcQ68FD5 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CltcQ68FD5 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CltcQ68FD5 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CltcQ68FD5 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CltcQ68FD5 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CltcQ68FD5 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CltcQ68FD5 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CltcQ68FD5 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CltcQ68FD5 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CltcQ68FD5 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CltcQ68FD5 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CltcQ68FD5 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CltcQ68FD5 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CltcQ68FD5 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CltcQ68FD5 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CltcQ68FD5 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CltcQ68FD5 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CltcQ68FD5 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CltcQ68FD5 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CltcQ68FD5 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CltcQ68FD5 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CltcQ68FD5 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CltcQ68FD5 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CltcQ68FD5 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CltcQ68FD5 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CltcQ68FD5 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CltcQ68FD5 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CltcQ68FD5 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CltcQ68FD5 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CltcQ68FD5 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms