Protein–RNA interactions for Protein: Q66JQ7

Knl1, Kinetochore scaffold 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knl1Q66JQ7 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Knl1Q66JQ7 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Knl1Q66JQ7 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Knl1Q66JQ7 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Knl1Q66JQ7 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Knl1Q66JQ7 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Knl1Q66JQ7 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Knl1Q66JQ7 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Knl1Q66JQ7 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Knl1Q66JQ7 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Knl1Q66JQ7 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Knl1Q66JQ7 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Knl1Q66JQ7 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Knl1Q66JQ7 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Knl1Q66JQ7 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Knl1Q66JQ7 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Knl1Q66JQ7 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Knl1Q66JQ7 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Knl1Q66JQ7 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Knl1Q66JQ7 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Knl1Q66JQ7 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Knl1Q66JQ7 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Knl1Q66JQ7 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Knl1Q66JQ7 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Knl1Q66JQ7 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Knl1Q66JQ7 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Knl1Q66JQ7 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Knl1Q66JQ7 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Knl1Q66JQ7 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Knl1Q66JQ7 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Knl1Q66JQ7 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Knl1Q66JQ7 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Knl1Q66JQ7 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Knl1Q66JQ7 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Knl1Q66JQ7 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Knl1Q66JQ7 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Knl1Q66JQ7 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Knl1Q66JQ7 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Knl1Q66JQ7 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Knl1Q66JQ7 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Knl1Q66JQ7 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Knl1Q66JQ7 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Knl1Q66JQ7 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Knl1Q66JQ7 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
Knl1Q66JQ7 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Knl1Q66JQ7 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
Knl1Q66JQ7 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Knl1Q66JQ7 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Knl1Q66JQ7 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Knl1Q66JQ7 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Knl1Q66JQ7 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Knl1Q66JQ7 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Knl1Q66JQ7 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Knl1Q66JQ7 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Knl1Q66JQ7 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Knl1Q66JQ7 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Knl1Q66JQ7 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Knl1Q66JQ7 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Knl1Q66JQ7 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Knl1Q66JQ7 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Knl1Q66JQ7 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Knl1Q66JQ7 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Knl1Q66JQ7 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Knl1Q66JQ7 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Knl1Q66JQ7 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Knl1Q66JQ7 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Knl1Q66JQ7 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Knl1Q66JQ7 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Knl1Q66JQ7 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Knl1Q66JQ7 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Knl1Q66JQ7 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Knl1Q66JQ7 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Knl1Q66JQ7 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC22■■□□□ 1.11
Knl1Q66JQ7 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Knl1Q66JQ7 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Knl1Q66JQ7 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Knl1Q66JQ7 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Knl1Q66JQ7 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Knl1Q66JQ7 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Knl1Q66JQ7 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Knl1Q66JQ7 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Knl1Q66JQ7 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Knl1Q66JQ7 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Knl1Q66JQ7 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Knl1Q66JQ7 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Knl1Q66JQ7 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Knl1Q66JQ7 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Knl1Q66JQ7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Knl1Q66JQ7 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Knl1Q66JQ7 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Knl1Q66JQ7 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Knl1Q66JQ7 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Knl1Q66JQ7 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Knl1Q66JQ7 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Knl1Q66JQ7 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Knl1Q66JQ7 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Knl1Q66JQ7 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Knl1Q66JQ7 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Knl1Q66JQ7 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Knl1Q66JQ7 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms