Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW7

Patj, InaD-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PatjQ63ZW7 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PatjQ63ZW7 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PatjQ63ZW7 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PatjQ63ZW7 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PatjQ63ZW7 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PatjQ63ZW7 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PatjQ63ZW7 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PatjQ63ZW7 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PatjQ63ZW7 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PatjQ63ZW7 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PatjQ63ZW7 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PatjQ63ZW7 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PatjQ63ZW7 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PatjQ63ZW7 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PatjQ63ZW7 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PatjQ63ZW7 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PatjQ63ZW7 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PatjQ63ZW7 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PatjQ63ZW7 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PatjQ63ZW7 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PatjQ63ZW7 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PatjQ63ZW7 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PatjQ63ZW7 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PatjQ63ZW7 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PatjQ63ZW7 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PatjQ63ZW7 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PatjQ63ZW7 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PatjQ63ZW7 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PatjQ63ZW7 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PatjQ63ZW7 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PatjQ63ZW7 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PatjQ63ZW7 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PatjQ63ZW7 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PatjQ63ZW7 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PatjQ63ZW7 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PatjQ63ZW7 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PatjQ63ZW7 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PatjQ63ZW7 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PatjQ63ZW7 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PatjQ63ZW7 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PatjQ63ZW7 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PatjQ63ZW7 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PatjQ63ZW7 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PatjQ63ZW7 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PatjQ63ZW7 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PatjQ63ZW7 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PatjQ63ZW7 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PatjQ63ZW7 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PatjQ63ZW7 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PatjQ63ZW7 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PatjQ63ZW7 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PatjQ63ZW7 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PatjQ63ZW7 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PatjQ63ZW7 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PatjQ63ZW7 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PatjQ63ZW7 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PatjQ63ZW7 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PatjQ63ZW7 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PatjQ63ZW7 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PatjQ63ZW7 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PatjQ63ZW7 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PatjQ63ZW7 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PatjQ63ZW7 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PatjQ63ZW7 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PatjQ63ZW7 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PatjQ63ZW7 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PatjQ63ZW7 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PatjQ63ZW7 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PatjQ63ZW7 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PatjQ63ZW7 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PatjQ63ZW7 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PatjQ63ZW7 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PatjQ63ZW7 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PatjQ63ZW7 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PatjQ63ZW7 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PatjQ63ZW7 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PatjQ63ZW7 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PatjQ63ZW7 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PatjQ63ZW7 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PatjQ63ZW7 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PatjQ63ZW7 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PatjQ63ZW7 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PatjQ63ZW7 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PatjQ63ZW7 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PatjQ63ZW7 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PatjQ63ZW7 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PatjQ63ZW7 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PatjQ63ZW7 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PatjQ63ZW7 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PatjQ63ZW7 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PatjQ63ZW7 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PatjQ63ZW7 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PatjQ63ZW7 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PatjQ63ZW7 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PatjQ63ZW7 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PatjQ63ZW7 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PatjQ63ZW7 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PatjQ63ZW7 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PatjQ63ZW7 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PatjQ63ZW7 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms