Protein–RNA interactions for Protein: Q62472

Lcn4, Vomeronasal secretory protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn4Q62472 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lcn4Q62472 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lcn4Q62472 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lcn4Q62472 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Lcn4Q62472 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lcn4Q62472 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lcn4Q62472 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lcn4Q62472 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lcn4Q62472 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lcn4Q62472 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lcn4Q62472 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lcn4Q62472 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lcn4Q62472 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lcn4Q62472 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lcn4Q62472 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lcn4Q62472 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lcn4Q62472 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lcn4Q62472 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lcn4Q62472 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lcn4Q62472 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lcn4Q62472 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lcn4Q62472 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lcn4Q62472 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lcn4Q62472 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lcn4Q62472 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lcn4Q62472 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lcn4Q62472 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Lcn4Q62472 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Lcn4Q62472 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Lcn4Q62472 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lcn4Q62472 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lcn4Q62472 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lcn4Q62472 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lcn4Q62472 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Lcn4Q62472 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lcn4Q62472 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lcn4Q62472 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lcn4Q62472 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lcn4Q62472 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lcn4Q62472 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lcn4Q62472 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lcn4Q62472 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Lcn4Q62472 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lcn4Q62472 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lcn4Q62472 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lcn4Q62472 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lcn4Q62472 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Lcn4Q62472 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lcn4Q62472 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lcn4Q62472 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lcn4Q62472 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lcn4Q62472 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lcn4Q62472 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lcn4Q62472 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lcn4Q62472 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lcn4Q62472 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lcn4Q62472 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lcn4Q62472 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lcn4Q62472 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lcn4Q62472 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lcn4Q62472 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lcn4Q62472 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lcn4Q62472 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lcn4Q62472 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lcn4Q62472 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lcn4Q62472 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lcn4Q62472 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lcn4Q62472 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lcn4Q62472 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lcn4Q62472 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lcn4Q62472 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lcn4Q62472 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Lcn4Q62472 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lcn4Q62472 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Lcn4Q62472 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lcn4Q62472 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lcn4Q62472 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lcn4Q62472 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lcn4Q62472 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lcn4Q62472 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lcn4Q62472 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lcn4Q62472 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lcn4Q62472 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lcn4Q62472 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lcn4Q62472 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lcn4Q62472 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lcn4Q62472 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lcn4Q62472 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lcn4Q62472 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lcn4Q62472 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lcn4Q62472 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lcn4Q62472 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lcn4Q62472 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lcn4Q62472 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lcn4Q62472 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lcn4Q62472 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lcn4Q62472 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lcn4Q62472 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lcn4Q62472 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lcn4Q62472 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms