Protein–RNA interactions for Protein: Q62460

Gm20865, (clone BALB3N), mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20865Q62460 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20865Q62460 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm20865Q62460 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm20865Q62460 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm20865Q62460 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm20865Q62460 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm20865Q62460 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm20865Q62460 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm20865Q62460 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm20865Q62460 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20865Q62460 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20865Q62460 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20865Q62460 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20865Q62460 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20865Q62460 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20865Q62460 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20865Q62460 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20865Q62460 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20865Q62460 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20865Q62460 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20865Q62460 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20865Q62460 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20865Q62460 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20865Q62460 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20865Q62460 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20865Q62460 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20865Q62460 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20865Q62460 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20865Q62460 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20865Q62460 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20865Q62460 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20865Q62460 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20865Q62460 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20865Q62460 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20865Q62460 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20865Q62460 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20865Q62460 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20865Q62460 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20865Q62460 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20865Q62460 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20865Q62460 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20865Q62460 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20865Q62460 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20865Q62460 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20865Q62460 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20865Q62460 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20865Q62460 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20865Q62460 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20865Q62460 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20865Q62460 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20865Q62460 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20865Q62460 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20865Q62460 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20865Q62460 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20865Q62460 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20865Q62460 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20865Q62460 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20865Q62460 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20865Q62460 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20865Q62460 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20865Q62460 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20865Q62460 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20865Q62460 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20865Q62460 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20865Q62460 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20865Q62460 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20865Q62460 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20865Q62460 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20865Q62460 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20865Q62460 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20865Q62460 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20865Q62460 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20865Q62460 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20865Q62460 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20865Q62460 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms