Protein–RNA interactions for Protein: Q62445

Sp4, Transcription factor Sp4, mousemouse

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp4Q62445 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sp4Q62445 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sp4Q62445 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Sp4Q62445 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sp4Q62445 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sp4Q62445 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sp4Q62445 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sp4Q62445 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sp4Q62445 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sp4Q62445 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sp4Q62445 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sp4Q62445 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sp4Q62445 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sp4Q62445 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sp4Q62445 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sp4Q62445 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Sp4Q62445 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sp4Q62445 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Sp4Q62445 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Sp4Q62445 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Sp4Q62445 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sp4Q62445 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sp4Q62445 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sp4Q62445 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sp4Q62445 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sp4Q62445 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sp4Q62445 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sp4Q62445 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sp4Q62445 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sp4Q62445 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sp4Q62445 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sp4Q62445 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sp4Q62445 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sp4Q62445 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sp4Q62445 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sp4Q62445 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sp4Q62445 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sp4Q62445 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sp4Q62445 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sp4Q62445 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sp4Q62445 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sp4Q62445 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sp4Q62445 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sp4Q62445 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sp4Q62445 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Sp4Q62445 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Sp4Q62445 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sp4Q62445 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sp4Q62445 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sp4Q62445 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Sp4Q62445 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sp4Q62445 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sp4Q62445 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sp4Q62445 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sp4Q62445 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sp4Q62445 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sp4Q62445 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sp4Q62445 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sp4Q62445 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sp4Q62445 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sp4Q62445 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sp4Q62445 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sp4Q62445 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sp4Q62445 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sp4Q62445 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sp4Q62445 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sp4Q62445 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sp4Q62445 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sp4Q62445 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sp4Q62445 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sp4Q62445 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sp4Q62445 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sp4Q62445 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sp4Q62445 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sp4Q62445 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sp4Q62445 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sp4Q62445 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sp4Q62445 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sp4Q62445 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Sp4Q62445 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sp4Q62445 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sp4Q62445 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sp4Q62445 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sp4Q62445 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sp4Q62445 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sp4Q62445 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sp4Q62445 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sp4Q62445 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Sp4Q62445 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sp4Q62445 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sp4Q62445 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sp4Q62445 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Sp4Q62445 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sp4Q62445 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sp4Q62445 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sp4Q62445 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sp4Q62445 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sp4Q62445 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sp4Q62445 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sp4Q62445 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms