Protein–RNA interactions for Protein: Q62189

Snrpa, U1 small nuclear ribonucleoprotein A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpaQ62189 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SnrpaQ62189 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SnrpaQ62189 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SnrpaQ62189 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SnrpaQ62189 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SnrpaQ62189 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SnrpaQ62189 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SnrpaQ62189 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SnrpaQ62189 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SnrpaQ62189 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SnrpaQ62189 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SnrpaQ62189 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SnrpaQ62189 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SnrpaQ62189 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SnrpaQ62189 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SnrpaQ62189 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SnrpaQ62189 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SnrpaQ62189 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SnrpaQ62189 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SnrpaQ62189 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SnrpaQ62189 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SnrpaQ62189 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SnrpaQ62189 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SnrpaQ62189 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SnrpaQ62189 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SnrpaQ62189 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SnrpaQ62189 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SnrpaQ62189 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SnrpaQ62189 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SnrpaQ62189 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SnrpaQ62189 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SnrpaQ62189 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SnrpaQ62189 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SnrpaQ62189 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SnrpaQ62189 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SnrpaQ62189 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SnrpaQ62189 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SnrpaQ62189 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SnrpaQ62189 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SnrpaQ62189 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SnrpaQ62189 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SnrpaQ62189 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SnrpaQ62189 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SnrpaQ62189 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SnrpaQ62189 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SnrpaQ62189 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SnrpaQ62189 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SnrpaQ62189 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SnrpaQ62189 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SnrpaQ62189 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SnrpaQ62189 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SnrpaQ62189 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SnrpaQ62189 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SnrpaQ62189 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SnrpaQ62189 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SnrpaQ62189 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SnrpaQ62189 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SnrpaQ62189 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SnrpaQ62189 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SnrpaQ62189 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SnrpaQ62189 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SnrpaQ62189 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SnrpaQ62189 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SnrpaQ62189 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SnrpaQ62189 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SnrpaQ62189 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SnrpaQ62189 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SnrpaQ62189 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SnrpaQ62189 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SnrpaQ62189 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SnrpaQ62189 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SnrpaQ62189 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SnrpaQ62189 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SnrpaQ62189 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SnrpaQ62189 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SnrpaQ62189 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SnrpaQ62189 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SnrpaQ62189 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SnrpaQ62189 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SnrpaQ62189 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SnrpaQ62189 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SnrpaQ62189 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SnrpaQ62189 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SnrpaQ62189 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SnrpaQ62189 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SnrpaQ62189 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SnrpaQ62189 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SnrpaQ62189 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SnrpaQ62189 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SnrpaQ62189 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SnrpaQ62189 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SnrpaQ62189 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SnrpaQ62189 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SnrpaQ62189 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SnrpaQ62189 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SnrpaQ62189 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SnrpaQ62189 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SnrpaQ62189 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SnrpaQ62189 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SnrpaQ62189 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms