Protein–RNA interactions for Protein: Q62159

Rhoc, Rho-related GTP-binding protein RhoC, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhocQ62159 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RhocQ62159 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RhocQ62159 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RhocQ62159 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RhocQ62159 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RhocQ62159 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RhocQ62159 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RhocQ62159 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RhocQ62159 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RhocQ62159 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RhocQ62159 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RhocQ62159 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RhocQ62159 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RhocQ62159 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RhocQ62159 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RhocQ62159 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RhocQ62159 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RhocQ62159 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RhocQ62159 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RhocQ62159 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RhocQ62159 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RhocQ62159 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RhocQ62159 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RhocQ62159 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RhocQ62159 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RhocQ62159 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RhocQ62159 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RhocQ62159 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RhocQ62159 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RhocQ62159 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RhocQ62159 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RhocQ62159 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RhocQ62159 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RhocQ62159 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RhocQ62159 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RhocQ62159 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RhocQ62159 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RhocQ62159 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RhocQ62159 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RhocQ62159 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RhocQ62159 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RhocQ62159 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RhocQ62159 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RhocQ62159 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RhocQ62159 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RhocQ62159 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RhocQ62159 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RhocQ62159 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RhocQ62159 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RhocQ62159 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RhocQ62159 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RhocQ62159 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RhocQ62159 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RhocQ62159 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RhocQ62159 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RhocQ62159 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RhocQ62159 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RhocQ62159 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RhocQ62159 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RhocQ62159 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RhocQ62159 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RhocQ62159 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RhocQ62159 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RhocQ62159 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RhocQ62159 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RhocQ62159 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RhocQ62159 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RhocQ62159 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RhocQ62159 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RhocQ62159 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RhocQ62159 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RhocQ62159 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RhocQ62159 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RhocQ62159 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RhocQ62159 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RhocQ62159 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RhocQ62159 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RhocQ62159 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RhocQ62159 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RhocQ62159 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RhocQ62159 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RhocQ62159 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RhocQ62159 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RhocQ62159 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RhocQ62159 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RhocQ62159 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RhocQ62159 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RhocQ62159 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RhocQ62159 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RhocQ62159 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RhocQ62159 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RhocQ62159 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RhocQ62159 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RhocQ62159 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RhocQ62159 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RhocQ62159 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RhocQ62159 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RhocQ62159 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RhocQ62159 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RhocQ62159 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms