Protein–RNA interactions for Protein: Q62132

Ptprr, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprrQ62132 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PtprrQ62132 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PtprrQ62132 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PtprrQ62132 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PtprrQ62132 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtprrQ62132 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtprrQ62132 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtprrQ62132 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtprrQ62132 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtprrQ62132 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtprrQ62132 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtprrQ62132 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtprrQ62132 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PtprrQ62132 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtprrQ62132 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtprrQ62132 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtprrQ62132 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtprrQ62132 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtprrQ62132 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtprrQ62132 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PtprrQ62132 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtprrQ62132 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtprrQ62132 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtprrQ62132 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtprrQ62132 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtprrQ62132 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtprrQ62132 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtprrQ62132 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtprrQ62132 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtprrQ62132 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtprrQ62132 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtprrQ62132 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtprrQ62132 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtprrQ62132 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtprrQ62132 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtprrQ62132 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtprrQ62132 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtprrQ62132 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtprrQ62132 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtprrQ62132 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PtprrQ62132 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
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PtprrQ62132 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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PtprrQ62132 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtprrQ62132 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
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PtprrQ62132 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PtprrQ62132 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PtprrQ62132 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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PtprrQ62132 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtprrQ62132 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtprrQ62132 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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PtprrQ62132 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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PtprrQ62132 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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PtprrQ62132 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtprrQ62132 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtprrQ62132 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtprrQ62132 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PtprrQ62132 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtprrQ62132 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
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PtprrQ62132 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtprrQ62132 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtprrQ62132 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtprrQ62132 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PtprrQ62132 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtprrQ62132 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtprrQ62132 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtprrQ62132 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtprrQ62132 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtprrQ62132 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtprrQ62132 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtprrQ62132 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtprrQ62132 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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PtprrQ62132 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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PtprrQ62132 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
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