Protein–RNA interactions for Protein: Q61738

Itga7, Integrin alpha-7, mousemouse

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga7Q61738 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga7Q61738 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga7Q61738 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga7Q61738 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga7Q61738 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga7Q61738 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga7Q61738 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga7Q61738 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga7Q61738 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga7Q61738 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga7Q61738 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga7Q61738 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga7Q61738 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga7Q61738 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga7Q61738 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga7Q61738 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga7Q61738 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga7Q61738 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga7Q61738 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga7Q61738 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga7Q61738 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga7Q61738 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga7Q61738 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga7Q61738 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga7Q61738 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga7Q61738 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga7Q61738 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga7Q61738 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itga7Q61738 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga7Q61738 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga7Q61738 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga7Q61738 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga7Q61738 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga7Q61738 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga7Q61738 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga7Q61738 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga7Q61738 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga7Q61738 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga7Q61738 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga7Q61738 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga7Q61738 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga7Q61738 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga7Q61738 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga7Q61738 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga7Q61738 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga7Q61738 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga7Q61738 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga7Q61738 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga7Q61738 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga7Q61738 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga7Q61738 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga7Q61738 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga7Q61738 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga7Q61738 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga7Q61738 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga7Q61738 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga7Q61738 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga7Q61738 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga7Q61738 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga7Q61738 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga7Q61738 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga7Q61738 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga7Q61738 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga7Q61738 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga7Q61738 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga7Q61738 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga7Q61738 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga7Q61738 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga7Q61738 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga7Q61738 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga7Q61738 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga7Q61738 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga7Q61738 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga7Q61738 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga7Q61738 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga7Q61738 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga7Q61738 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga7Q61738 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga7Q61738 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga7Q61738 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga7Q61738 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga7Q61738 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga7Q61738 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga7Q61738 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga7Q61738 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga7Q61738 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga7Q61738 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga7Q61738 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga7Q61738 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga7Q61738 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga7Q61738 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga7Q61738 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga7Q61738 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga7Q61738 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga7Q61738 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga7Q61738 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga7Q61738 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga7Q61738 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga7Q61738 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga7Q61738 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms